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한국축산학회(구 한국동물자원과학회) 한국축산학회지 한국축산학회지 제54권 제6호
발행연도
2012.1
수록면
383 - 394 (12page)

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Microarray analyses provide information that can be used to enhance the efficiency of livestock production. For example, microarray profiling can potentially identify the biological processes responsible for the phenotypic characteristics of porcine liver. We performed transcriptome profiling to identify differentially expressed genes(DEGs) in liver of pigs from two breeds, the Korean native pigs(KNP) and Yorkshire pigs. We correctly identified expected DEGs using factor analysis for robust microarray summarization(FARMS) and robust multi-array average(RMA) strategies. We identified 366 DEGs in liver(p<0.05, fold- change>2). We also performed functional analyses, including gene ontology and molecular network analyses. In addition, we identified the regulatory relationship between DEGs and their transcription factors using in silico and qRT-PCR analysis. Our findings suggest that DEGs and their transcription factors may have a potential role in adipogenesis and/or lipid deposition in liver tissues of two pig breeds.
#Korean native pig #Yorkshire #microarray #Molecular network #Transcription factor

목차

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Babol, J. / 1998 / Hepatic metabolism of skatole in pigs by cytochrome P4502E1 / Journal of Animal science 76 (3) : 822 ~ google schola Babol, J. / 1998 / Relationship between oxidation and conjugation metabolism of skatole in pig liver and concentrations of skatole in fat / Journal of animal science 76 (3) : google schola Bingham, N. C. / 2006 / Development of a steroidogenic factor 1/Cre transgenic mouse line / Genesis 44 (9) : 419 ~ 424 google schola Chen, Z. / 2005 / Friedman, J. M. 2005. Krox20 stimulates adipogenesis via C/EBPbeta-dependent and -independent mechanisms / Cell Metab 1 (2) : 93 ~ 106 google schola Choe, S. E. / 2005 / rred analysis methods for Affymetrix GeneChips revealed by a wholly defined control dataset / Genome Biol 6 (2) : R16 ~ google schola

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