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As an initial step to define the molecular mechanism of diapause during embryogenesis of the silkworm, Bombyx mori, mRNA transcripts from diapausing eggs and diapause-activated eggs were compared by differential expression using cDNA microarray. Twenty-four individual cDNA clones were identified. Amomg them, ten genes including alcohol dehydrogenase, dead box-1, cytochrome oxidase subunit I and 18 wheeler showed increased expression in the diapause-activated eggs. The rest of fourteen genes showed increased expression in diapausing eggs.

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