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자료유형
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저널정보
한국육종학회 한국육종학회지 한국육종학회지 제40권 제1호
발행연도
2008.1
수록면
1 - 7 (7page)

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An attempt was made to link rice embryo proteins to DNA sequences and to understand their functions. One hundred of the 700 spots detected on the embryo 2-DE gels were microsequenced. Of these, 28% of the embryo proteins were matched to DNA sequences with known functions, but 72% of the proteins were unknown in functions as previously reported (Woo et al. 2002). In addition, twenty-four protein spots with 100% of homology and nine with over 80% were matched to ESTs (expressed sequence tags) after expanding the amino acid sequences of the protein spots by Database searches using the available rice EST databases at the NCBI (http://www/ncbi.nlm.nih.gov/) and DDBJ (http://www.ddbj.nig.ac.jp/). The chromosomal location of some proteins were also obtained from the rice genetic map provided by Japanese Rice Genome Research Program (http://rgp.dna.affrc.go.jp). The DNA sequence databases including EST have been reported for rice (Oryza sativa L.) now provides whole or partial gene sequence, and recent advances in protein characterization allow the linking proteins to DNA sequences in the functional analysis. This work shows that proteome analysis could be a useful tool strategy to link sequence information and to functional genomics.
#rice #Oryza sativa L. #two-dimensional electrophoresis #Cleveland peptide mapping #amino acid sequence analysis #EST database #proteome analysis

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참고문헌 (16)

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Adams, M.D / 1991 / Complementary DNAsequencing: expressed sequence tags and human genome project / Science 252 : 1651 ~ 1656 google schola Cleveland, D.W / 1977 / Peptide mapping by limited proteolysis in sodium dodecyl sulphate and analysis by gel electrophoresis / J. Biol. Chem 252 : 1102 ~ 1105 google schola Davenport, R, J / 2001 / Rice genome: Syngenta finishes, consortium goes on / Science 291 : 807 ~ google schola Dickson, D / 2001 / Commercial sector scores success with whole rice genome / Nature : 551 ~ google schola Futcher, B / 1999 / A sampling of the yeast proteome / Mol. Cell. Biol 19 : 7357 ~ 7368 google schola

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