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Two different types of polyploid progenies were analyzed by genomic in situ hybridization (GISH) in order to estimate the extent of homoeologous recombination. One set of these had originated from a diploid F1 hybrid between Lilium longiflorum ´ L. rubellum (LR, 2n=2x=24) followed by somatic chromosome doubling and crossing the tetraploid (LLRR, 2n=4x=48) to L. longiflorum (LL) as well as to the Oriental hybrid (OO). These crosses gave rise to two types of triploids (2n=3x=36) of the genomic composition LLR and OLR, through the functioning of alloploid 2x-gametes, from LLRR. The GISH analysis revealed no homoeologous recombination in the case of LLR- and OLR-triploids. This could be explained by preferential pairing of homologous chromosomes in LLRR hybrids. The second sets of progenies were derived from unreduced (2n) gametes of the diploid F1 hybrid between L. longiflorum ´ Asiatic hybrid (LA, 2n=2x=24). ALA-triploids and AALA-tetraploids showed considerable intergenomic recombination explainable by homoeologous pairing in LA-hybrid during the origin of 2n-gametes.
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