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논문 기본 정보

자료유형
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저자정보
저널정보
한국육종학회 한국육종학회지 한국육종학회지 제42권 제1호
발행연도
2010.1
수록면
11 - 22 (12page)

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The population structure of a domesticated species is influenced by the natural history of the populations of its pre-domesticated ancestors, as well as by the breeding system and complexity of breeding practices implemented by humans. In the genetic and population structure analysis of 122 South Asia collections using 29 simple sequence repeat (SSR) markers, 362alleles were detected, with an average of 12.5 per locus. The average expected heterozygosity and polymorphism information content (PIC) for each SSR locus were 0.74 and 0.72,respectively. The model-based structure analysis revealed the presence of three clusters with the 91.8% (shared > 75%) membership, with 8.2% showing admixture. The genetic distances of Clusters 1–3were 0.55, 0.56, and 0.68, respectively. Polymorphic information content followed the same trend (Cluster 3 had the highest value and Cluster 1 had smallest value), with genetic distances for each cluster of 0.52, 0.52, and 0.65, respectively. This result could be used for supporting rice breeding programs in South Asia countries.
#molecular diversity #population structure #simple sequence repeats #SSRs) #rice

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Bao JS / 2002 / Microsatellites in starch-synthesizing genes in relation to starch physicochemical properties in waxy rice (Oryza sativa L.) / Theoretical and Applied Genetic google schola Blair MW / 2002 / Fluorescentlabeled microsatellite panels useful for detecting allelic diversity in cultivated rice (Oryza sativa L.) / Theor Appl Genet. 105 : 449 ~ 457 google schola Chang TT / 1976 / The origin, evolution, cultivation, dissemination, and diversification of Asian and African rice / Euphytica. 25 : 425 ~ 441 google schola Coburn JR / 2002 / Design and application of microsatellite marker panels for semiautomated genotyping of rice (Oryza sativa L.) / Crop Sci. 42 : 2092 ~ 2099 google schola Crawford GW / 1998 / The origins of rice agriculture: recent progress in East Asia / Antiquity. 72 : 858 ~ 866 google schola

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