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저자정보
저널정보
대한구강악안면외과학회 대한구강악안면외과학회지 대한구강악안면외과학회지 제37권 제6호
발행연도
2011.1
수록면
550 - 555 (6page)

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Chromosomal loss of heterozygosity (LOH) is a common mechanism for the inactivation of tumor suppressor genes in human epithelial cancers. LOH patterns can be generated through allelotyping using polymorphic microsatellite markers; however, owing to the limited number of available microsatellite markers and the requirement for large amounts of DNA, only a modest number of microsatellite markers can be screened. Hybridization to single nucleotide polymorphism (SNP) arrays using Affymetarix GeneChip Mapping 10 K 2.0 Array is an efficient method to detect genome-wide cancer LOH. We determined the presence of LOH in oral SCCs using these arrays. DNA was extracted from tissue samples obtained from 10 patients with tongue SCCs who presented at the Hospital of Tokyo Dental College. We examined the presence of LOH in 3 of the 10 patients using these arrays. At the locus that had LOH, we examined the presence of LOH using microsatellite markers. LOH analysis using Affymetarix GeneChip Mapping 10K Array showed LOH in all patients at the 1q31.1. The LOH regions were detected and demarcated by the copy number 1 with the series of three SNP probes. LOH analysis of 1q31.1 using microsatellite markers (D1S1189, D1S2151, D1S2595) showed LOH in all 10 patients (100). Our data may suggest that a putative tumor suppressor gene is located at the 1q31.1 region. Inactivation of such a gene may play a role in tongue tumorigenesis.
#Tongue squamous cell carcinoma #Loss of heterozygosity #Copy number abnormality #Single nucleotide polymorphism #tumor suppressor gene

목차

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참고문헌 (22)

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[단행 google schola Arai K / 2001 / Frequent allelic loss/imbalance on the short arm of chromosome 3 in tongue cancer / Bull Tokyo Dent Coll 42 : 151 ~ 157 google schola Arai K / 2002 / The presence of candidate tumor suppressor gene loci at chromosome 3p for oral squamous cell carcinomas / Oral Oncol 38 : 763 ~ 771 google schola Dumur CI / 2003 / Genome-wide detection of LOH in prostate cancer using human SNP microarray technology / Genomics 81 : 260 ~ 269 google schola Hoque MO / 2003 / Genome-wide genetic characterization of bladder cancer: a comparison of high-density single-nucleotide polymorphism arrays and PCR-based microsatellite ana google schola

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