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자료유형
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저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제22권 제2호
발행연도
2012.1
수록면
248 - 255 (8page)

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In order to develop a protocol to quantify cyanobacteria and Microcystis simultaneously, the primers and probe were designed from the conserved regions of 16S rRNA gene sequences of cyanobacteria and Microcystis, respectively. Probe match analysis of the Ribosomal Database Project showed that the primers matched with over 97% of cyanobacterial 16S rRNA genes, indicating these can be used to amplify cyanobacteria specifically. The TaqMan probe, which is located between two primers, matched with 98.2% of sequences in genus GpXI, in which most Microcystis strains are included. The numbers of cyanobacterial genes were estimated with the emission of SYBR Green from the amplicons with two primers,whereas those of Microcystis spp. were measured from the fluorescence of CAL Fluor Gold 540 emitted by exonuclease activity of Taq DNA polymerase in amplification. It is expected that this method enhances the accuracy and reduces the time to count cyanobacteria and potential toxigenic Microcystis spp. in aquatic environmental samples.
#Cyanobacteria #Microcystis #real-time PCR #simultaneous quantification

목차

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