Transcriptome Analysis of Phosphate Starvation Response in Escherichia coli

BAEK; JONG HWAN; 이상엽

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자료유형: 학술저널

저자정보: BAEK JONG HWAN 이상엽

저널정보: 한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제17권 제2호

발행연도: 2007.1

수록면: 244 - 252 (9page)

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Escherichia coli has a PhoR-PhoB two-componentregulatory system to detect and respond to the changes ofenvironmental phosphate concentration. For the E. coli W3110strain growing under phosphate-limiting condition, the changesof global gene expresion levels were investigated by usinggenes that are involved in phosphate metabolism wereincreased as phosphate became limited, whereas those of thegenes involved in ribosomal protein or amino acid metabolismwere decreased, owing to the stationary phase response. Theupregulated genes could be divided into temporarily andpermanently inducible genes by phosphate starvation. Atthe peak point showing the highest expression levels ofthe phoB and phoR genes under phosphate-limiting condition,the phoB- and/or phowere investigated in detail by comparing the gene expressionlevels among the wild-type and phoB and/or phoR mutantstrains. Overall, the phoB mutation was epistatic over thephoR mutation. It was found that PhoBR and PhoB wereresponsible for the upregulation of the phosphonate orglycerol phosphate metabolism and high-afinity phosphatetransport system, respectively. These results show the complexregulation by the PhoR-PhoB two-component regulatoryE. coli.

#Phosphate starvation response #PhoR-PhoB two-component regulatory system #Escherichia coli #DNA microaray #transcriptomePhosphorus is an essential element of various biomolecules #and has an important role in signal transfer pathways [17].Moreover #ph

참고문헌 (18)

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Baek, J. H / 2006 / Novel gene members in the Pho regulon of Escherichia coli 264 : 104 ~ 109

Datsenko, K. A / 2000 / One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products 97 : 6640 ~ 6645

Eaton, A. D / 1995 / Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater : 4,106 ~ 4,115

Gourse, R. L / 1996 / rRNA transcription and growth ratedependent regulation of ribosome synthesis in Escherichia coli 50 : 645 ~ 677

Han, J. S / 1999 / PhoB-dependent transcriptional activation of the iciA gene during starvation for phosphate in Escherichia coli 262 : 448 ~ 452

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