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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제20권 제8호
발행연도
2010.1
수록면
1,163 - 1,178 (16page)

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Plasmids play important roles in horizontal gene transfer among Vibrionaceae, but surprisingly little is known about their replication and incompatibility systems. In this study, we successfully developed a bioinformatics-assisted strategy of experimental identification of seven Vibrio plasmid replicons. Comparative sequences analysis of the seven Vibrio plasmid replicons obtained in this study together with eight published Vibrionaceae plasmid sequences revealed replicationparticipating elements involved in the ColE1 mode of replication initiation and regulation. Like plasmid ColE1,these Vibrionaceae plasmids encode two RNA species (the primer RNA and the antisense RNA) for replication initiation and regulation, and as a result, the 15 Vibrionaceae plasmids were designated as ColE1-like Vibrionaceae (CLV) plasmids. Two subgroups were obtained for the 15 CLV plasmids,based on comparison of replicon organization and phylogenetic analysis of replication regions. Coexistence of CLV plasmids were demonstrated by direct sequencing analysis and Southern hybridization, strongly suggesting that the incompatibility of CLV plasmids is determined mainly by the RNA I species like the ColE1-like plasmids. Sequences resembling the conserved Xer recombination sites were also identified on the CLV plasmids, indicating that the CLV plasmids probably use the host site-specific recombination system for multimer resolution like that used by ColE1-like plasmids. All the results indicated that the 15 plasmids form a new ColE1-like group, providing a basis for the rapid characterization and classification of Vibrionaceae plasmids.
#Vibrio #plasmids #replication #RNA #compatibility #replication initiation

목차

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참고문헌 (23)

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Barbieri, E / 1999 / Occurrence, diversity, and pathogenicity of halophilic Vibrio spp. and non-O1 Vibrio cholerae from estuarine waters along the Italian Adriatic coast / Ap google schola Bistue, A. J. C. S / 2006 / Vibrio cholerae InV117, a class 1 integron harboring aac(6_)-Ib and blaCTX-M-2, is linked to transposition genes / Antimicrob. Agents Chemother 50 google schola Bjorklof, K / 1995 / High-frequency of conjugation versus plasmid segregation of RP1 in epiphytic Pseudomonas syringae population / Microbiology 141 : 2719 ~ 2727 google schola Blakely, G / 1993 / Two related recombinases are required for site-specific recombination at dif and cer in E. coli K12 / Cell 75 : 351 ~ 361 google schola Blakely, G. W / 1994 / Interactions of the sitespecific recombinases XerC and XerD with the recombination site dif / Nucl. Acids Res 22 : 5613 ~ 5620 google schola

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