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논문 기본 정보

자료유형
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저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제23권 제10호
발행연도
2013.1
수록면
1,381 - 1,385 (5page)

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The centipede Scolopendra subpinipes mutilans is a medicinally important arthropod species. However, its transcriptome is not currently available and transcriptome analysis would be useful in providing insight into a molecular level approach. Hence, we performed de novo RNA sequencing of S. subpinipes mutilans using next-generation sequencing. We generated a novel peptide (scolopendrasin II) based on a SVM algorithm, and biochemically evaluated the in vitro antimicrobial activity of scolopendrasin II against various microbes. Scolopendrasin II showed antibacterial activities against gram-positive and -negative bacterial strains, including the yeast Candida albicans and antibiotic-resistant gram-negative bacteria, as determined by a radial diffusion assay and colony count assay without hemolytic activity. In addition, we confirmed that scolopendrasin II bound to the surface of bacteria through a specific interaction with lipoteichoic acid and a lipopolysaccharide, which was one of the bacterial cell-wall components. In conclusion, our results suggest that scolopendrasin II may be useful for developing peptide antibiotics.
#Antimicrobial peptide #SVM algorithm #α-helical #Scolopendra subpinipes mutilans

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