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저널정보
한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 한국미생물·생명공학회지 제46권 제2호
발행연도
2018.1
수록면
162 - 170 (9page)

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Non-typhoidal Salmonella is one of the main pathogens causing food-borne illness in humans, with up to 20% of cases resulting from consumption of pork products. Over the gastroenteritis signs, multidrug resistant Salmonella has arisen. In this study, pan-susceptible phenotypic strains of Salmonella enterica serotype Weltevreden recovered from pig production chain in Chiang Mai, Thailand during 2012−2014 were chosen for analysis. The aim of this study was to use whole genome sequencing (WGS) data with an emphasis on antimicrobial resistance gene investigation to assess their pathogenic potential and genetic diversity determination based on whole genome Multilocus Sequence Typing (wgMLST) to expand epidemiological knowledge and to provide additional guidance for disease control. Analyis using ResFinder 3.0 for WGS database tracing found that one of pan-susceptible phenotypic strain carried five classes of resistance genes: aminoglycoside, beta-lactam, phenicol, sulfonamide, and tetracycline associated genes. Twenty four and 36 loci differences were detected by core genome Multilocus Sequence Typing (cgMLST) and pan genome Multilocus Sequence Typing (pgMLST), respectively, in two matching strains (44/13 vs A543057 and A543056 vs 204/13) initially assigned by conventional MLST and Pulsed-field Gel Electrophoresis (PFGE). One hundread percent discriminant ability can be achieved using the wgMLST technique. WGS is currently the ultimate molecular technique for various in-depth studies. As the findings stated above, a new of “gold standard typing method era” for routine works in genome study is being set.

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Carraminana JJ / 2002 / High prevalence of multiple resistance to antibiotics in Salmonella serovars isolated from a poultry slaughterhouse in Spain / Vet Microbiol. 104:133~139 google schola Rostagno MH / 2012 / Pre-harvest risk factors for Salmonella enterica in pork production / Food Res. Int. 45:634~640 Crossref Kuang X / 2015 / Serotypes and antimicrobial susceptibility of Salmonella spp. isolated from farm animals in China / Front. Microbiol. 6:602 google schola Majowicz SE / 2010 / The global burden of nontyphoidal Salmonella gastroenteritis / Clin. Infect. Dis. 50:882~889 Crossref Campioni F / 2012 / Genetic diversity, virulence genes and antimicrobial resistance of Salmonella Enteritidis isolated from food and humans over a 24-year period in Brazil / Food Microbiol. 32:254~264 Crossref

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