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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
대한임상미생물학회 Annals of Clinical Microbiology Annals of Clinical Microbiology 제19권 제4호
발행연도
2016.1
수록면
110 - 120 (11page)

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배경: 본 연구에서는 그람양성세균 식중독관련 Bacillus 균주를 대상으로 MALDI-TOF MS를 이용한 동정결과를 VITEK 2 system (bioMérieux, France), 16S rRNA 염기서열 분석결과와 비교하고 MALDI-TOF MS 동정률을 높이기 위한 단백체 기반 국내임상분리주 데이터베이스를 제작하고자 하였다. 방법: 세균의 동정은 VITEK 2 system (bioMérieux), API kit (bioMérieux, France), 16S rRNA 유전자 염기서열, MALDI-TOF MS 분석을 이용하였다. 병원성확인을 위하여 multiplex PCR 방법을 이용하여 독성 유전자를 확인하였다. 세균의 단백체 프로파일의 추출 및 데이터베이스는 제작은 MALDI BioTyper 3.0 (Bruker Daltonics, Germany)을 이용하여 수행하였고 16S rRNA 유전자 기반 계통수, repetitive-sequence fingerprinting 계통분석결과와 비교분석을 수행하였다. 결과: Bacillus 균주 30주에 대한 생화학적 동정법, 16S rRNA 유전자 염기서열분석 및 MALDI-TOF MS 방법에 의한 종 수준 동정률은 40%, 80%, 76.3%였다. 제작된 단백체 기반 MSP dendrogram을 16S rRNA 유전자기반 계통수 및 rep-PCR fingerprinting 계통수와 비교하였을 때 종별 구분이 효과적으로 이루어졌음을 확인할 수 있었다. 결론: Bacillus 균주들의 동정에서 MALDI-TOF MS는 VITEK 2 system (bioMérieux)보다 효과적인 동정방법이었다. MALDI- TOF MS는 16S rRNA 유전자 기반 동정법과도 비슷한 수준의 동정률을 나타냈으며 단백체 기반 국내임상분리주 데이터베이스를 지속적으로 확보한다면 동정률이 훨씬 높아질 것으로 기대되었다. [Ann Clin Microbiol 2016;19:110-120]

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