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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
연세대학교 의과대학 Yonsei Medical Journal Yonsei Medical Journal 제53권 제2호
발행연도
2012.1
수록면
377 - 385 (9page)

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Purpose: The purpose of the present study was to investigate the aberrance of histone H3 lysine 4 trimethylation (H3K4me3) in patients with IgA Nephropathy (IgAN). Materials and Methods: In this study, H3K4me3 variations in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from 15 IgAN patients and 15 healthy subjects were analyzed using chromatin immunoprecipitation linked to microarrays analysis (ChIP-chip). ChIP real-time PCR was used to validate the microarray results. Expression analysis by quantitative real-time PCR (qRT-PCR) revealed correlations between mRNA and H3K4me3 levels. DNA methylation status was analyzed by quantitative methylation-specific PCR. Results: We found that 321 probes displayed significant H3K4me3 differences in IgAN patients compared with healthy controls. Among these probes, 154 probes displayed increased H3K4me3and 167 probes demonstrated decreased H3K4me3. For further validation, we selected 4 key relevant genes (FCRL4, GALK2, PTPRN2 and IL1RAPL1) to study. The results of ChIP real-time PCR coincided well with the microarray data. Quantitative RT-PCR revealed the correlations between the mRNA expression and the methylation levels of H3K4me3. Different degrees of DNA methylation alterations appeared on the selected positive genes. Conclusion: Our studies indicated that there were significant alterations in H3K4me3 in IgAN patients. These findings may help to explain the disturbed immunity and abnormal glycosylation involved in IgAN patients.
#Chromatin immunoprecipitation #histone H3 lysine 4 #IgA nephropathy #quantitative methylation-specific PCR #trimethylation

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참고문헌 (28)

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Bannister AJ / 2004 / Histone methylation: recognizing the methyl mark / Methods Enzymol 376 : 269 ~ 288 google schola Barratt J / 2007 / Immunopathogenesis of IgAN / Semin Immunopathol 29 : 427 ~ 443 google schola Baylin SB / 2000 / DNA hypermethylation in tumorigenesis: epigenetics joins genetics / Trends Genet 16 : 168 ~ 174 google schola Bernstein BE / 2005 / Genomic maps and comparative analysis of histone modifications in human and mouse / Cell 120 : 169 ~ 181 google schola Eijgenraam JW / 2008 / IgA1 glycosylation in IgA nephropathy: as sweet as it can be / Kidney Int 73 : 1106 ~ 1108 google schola

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