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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국자료분석학회 Journal of The Korean Data Analysis Society Journal of The Korean Data Analysis Society 제15권 제2호
발행연도
2013.1
수록면
677 - 684 (8page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2013

유전자 사이트 내 질병 발현에 영향을 주는 중심유전자 탐색방법
황용선 수학정보통계과 2013.01 학위논문
사회네트워크분석을 이용한 질병 발현 유전자 탐색연구
황용선 ,  강창완 ,  김규곤 외 1명 Journal of The Korean Data Analysis Society 2013.01 학술저널

초록· 키워드

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DNA 염기서열 정보는 개인의 질병관련 정보를 파악할 수 있는 핵심적인 데이터이다. 최근 DNA 메틸화(DNA methylation) 측정을 통한 암 진단 기술이 개발되고 있으며, 메틸화 값 이상으로 인한 질병에 관한 연구도 활발히 진행되고 있다. 본 연구에서는 염기서열 데이터의 DNA 메틸화 값을 이용하여 정상군과 질병군(암환자)의 차이를 맨-휘트니 검정(Mann-Whitney test)을 이용하여 분석하였고 또한 만 개가 넘는 유전자들의 다중비교문제를 보정하기 위하여 FDR(false discovery rate) 기법을 이용한 후 p값을 보정한 Q값을 구하였다. 그리고 정상군, 질병군간 차이가 있는 유전자 사이트들을 이용해 사회네트워크분석(social network analysis)을 실시하였다. 분석 결과 질병군에 연결되어 있는 유전자 사이트 노드를 찾아내었고, 중심성(centrality)이 가장 높은 유전자 사이트 그룹과 나머지 그룹(중심성이 낮은 그룹)의 차이를 맨-휘트니 검정을 통해 알아보았다. 유의수준 0.05에서 두 그룹 간 유의한 차이가 있었고, 유전자 사이트 내에서 질병발현에 영향을 주는 중심성이 가장 높은 유전자 그룹을 찾아낼 수 있었다.
#DNA 메틸화 #사회네트워크분석 #맨-위트니 검정 #FDR. #DNA methylation #Social network analysis #Mann-Whitney test #FDR.

목차

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참고문헌 (7)

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Huh, M. / 2010 / Introduction to Social Network Analysis using R / Freedomacademy google schola Kang, G. H. / 2010 / Epigenetics : Understandings about DNA methylation in carcinogenesis / Korea Medcine google schola Nam, S. W. / 2011 / Introduction to Genetic Engineering / Life Science google schola 배재동 / 2009 / 학생 친밀도 네트워크에서 중심성 분석 및 활용방안 / Journal of The Korean Data Analysis Society 11 (3) : 1467 ~ 1478 google schola 이재원 / 2006 / 질병관련유전자와 환경적요인의 상호작용에 관한 모의실험 연구 / Journal of The Korean Data Analysis Society 8 (3) : 927 ~ 938 google schola

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