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논문 기본 정보

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저자정보
저널정보
한국자료분석학회 Journal of The Korean Data Analysis Society Journal of The Korean Data Analysis Society 제15권 제4호
발행연도
2013.1
수록면
1,871 - 1,881 (11page)

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계통분류학에서 분자계통분석은 단일 염기로 분석된 계통수의 정확도가 상대적으로 낮고 이용 가능한 염기서열의 데이터베이스가 기하급수적으로 성장하고 있기 때문에 다중 유전자 염기서열의 유합계통분석(combined phylogenetic analysis)의 적용이 점점 늘어나고 있는 추세이다. 부적합 길이 차(incongruence length difference, ILD) 검정은 다중 유전자 염기서열로부터 최대절약법(maximum parsimony)에 의해 추정된 계통수(phylogenetic tree)의 부적합도를 탐지하기 위한 가장 대표적인 추론법이다. 본 논문에서는 다중 유전자 염기서열을 이용한 계통수 작성의 적정성을 평가하기 위해 ILD 검정에 대해 알아보고, 실증분석으로 홍조류 33 종의 미토콘드리아 COI 유전자 및 엽록체 rbcL과 UPA 유전자 등 3 종류의 DNA 염기서열에 대하여 유합계통수를 작성하였다. 결론적으로 ILD 검정은 유합계통분석의 가능성을 진단하기 위한 가장 적절한 도구로 평가된다.
#분자계통 #다중 유전자 염기서열 #유합계통수 #ILD 검정 #최대절약법. #molecular phylogeny #multiple gene sequences #combined phylogenetic tree #ILD test #maximum parsimony.

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참고문헌 (15)

참고문헌 신청
Barker, F. K. / 2002 / The utility of the incongruence length difference test / Systematic Biology 51 : 625 ~ 637 google schola Bull, J. J. / 1993 / Partitioning and combining data in phylogenetic analysis / Systematic Biology 42 (3) : 384 ~ 397 google schola Cunningham, C. W. / 1997 / Can Three Incongruence Tests Predict When Data Should be Combined? / Molecular Biology and Evolution 14 (7) : 733 ~ 740 google schola Farris, J. S. / 1995 / Constructing a significance test for incongruence / Systematic Biology 44 : 570 ~ 572 google schola Farris, J. S. / 1995 / Testing significance of incongruence / Cladistics 10 : 315 ~ 319 google schola

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