Molecular Identification of the Toxic Alexandrium tamiyavanichii (Dinophyceae) by the Whole-cell FISH Method

김창훈; 김충재; Yoshihiko Sako; Sada-Aki Yoshimatsu

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자료유형: 학술저널

저자정보: 김창훈 김충재 Yoshihiko Sako Sada-Aki Yoshimatsu

저널정보: 한국수산과학회 Fisheries and Aquatic Sciences Fisheries and Aquatic Sciences 제7권 제4호

발행연도: 2004.1

수록면: 175 - 183 (9page)

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The dinoflagellate Alexandrium tamiyavanichii Balech, a producer of toxins causing paralytic shellfish poisoning (PSP), has recently been considered as one of main organisms responsible for toxication of shellfish in Japan. In this study, A. tamiyavanichii was subjected to a molecular phylogenetic analysis inferred from 28S rDNA D1-D2 sequences and a species-specific LSU rRNA-targeted oligonucleotide DNA probe was designed to identify A. tamiyavanichii using the whole cell-FISH (fluorescence in situ hybridization). The sequences of the 28S rDNA D1-D2 region of A. tamiyavanichii showed no difference from A. cohorticular AF174614 (present name A. tamiyavanichii) and formed a distinct clade from the ‘tamarensis species complex’. The probe, TAMID2, reacted specifically with A. tamiyavanichii cultured cells, without any cross-reaction with other species belonging to the same genus, including A. tamarense, A. catenella, A. affine, A. fraterculus, A. insuetum and A. pseudogonyaulax. In a test of cross- reactivity with a field sample, TAMID2 reacted consistently with only A. tamiyavanichii, indicating that the present protocol involving the TAMID2 probe might be useful for detecting toxic A. tamiyavanichii in a simple and rapid manner.

#Whole cell-FISH #fluorescence in situ hybridization) #DNA probe #Alexandrium tamiyavanichii

참고문헌 (26)

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/ / Fluorescent oligonucleotide probing of whole cells for determi- native and environmental studies in microbiology : 762 ~ 770

/ / Identification of Pseudo-nitzschia australis (Bacillariophyceae) using rRNA-targeted probes in whole cell and sandwich hybridization formats. 35, : 190 ~ 197

/ 1984 / Distance methods for inferring phy- logenies tion : 16 ~ 24

/ 1985 / Confidence limits on phylogenies tion : 783 ~ 791

/ 1985 / Morphology of Protogonyaulax ta- marensis Taylor from Japanese coastal waters : 529 ~ 537

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