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논문 기본 정보

자료유형
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저자정보
저널정보
대한진단검사의학회 Annals of Laboratory Medicine Annals of Laboratory Medicine 제31권 제2호
발행연도
2011.1
수록면
107 - 114 (8page)

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Background: We evaluated the efficacy of multilocus sequence typing (MLST) for assessing the genetic relationship among Candida albicans isolates from patients with candidemia in a hospital setting. Methods: A total of 45 C. albicans isolates from 21 patients with candidemia were analyzed. The MLST results were compared with results obtained by Southern blot hybridization (C1 fingerprinting) and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). PFGE analysis included karyotyping and restriction endonuclease analysis of genomic DNAs using BssHII (REAG-B) and SfiI (REAG-S). Results: The 45 isolates yielded 20 unique diploid sequence types (DSTs) by MLST, as well as 12 karyotypes, 15 REAG-B patterns, 13 REAG-S patterns, and 14 C1 fingerprinting types. Microevolution among intra-individual isolates was detected in 6, 5, 3, 5, and 7 sets of isolates by MLST (1 or 2 allelic differences), REAG-B, REAG-S, C1 fingerprinting, and a combination of all methods, respectively. Among 20 DSTs, 17 were unique, and 3 were found in more than 1 patient. The results of 2 DSTs obtained from 9 patient isolates were in agreement with REAG and C1 fingerprinting patterns. However, the remaining DST, which was shared by 2 patient isolates, showed 2 different PFGE and C1 fingerprinting patterns. In addition, 3 sets of isolates from different patients, which differed in only 1 or 2 alleles by MLST, also exhibited different PFGE or C1 fingerprinting patterns. Conclusions: MLST is highly discriminating among C. albicans isolates, but it may have some limitations in typing isolates from different patients, which may necessitate additional analysis using other techniques.
#Candia albicans #Multilocus sequence typing #Pulsed-field gel electrophoresis #Southern hybridization #Genotyping

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Asmundsdottir LR / 2008 / Molecular epidemiology of candidemia: evidence of clusters of smoldering nosocomial infections / Clin Infect Dis 47 : 17 ~ 24 google schola Bougnoux ME / 2003 / Collaborative consensus for optimized multilocus sequence typing of Candida albicans / J Clin Microbiol 41 : 5265 ~ 5266 google schola Bougnoux ME / 2004 / Multilocus sequence typing of Candida albicans: strategies, data exchange and applications / Infect Genet Evol 4 : 243 ~ 252 google schola Chen KW / 2006 / Multilocus sequence typing for analyses of clonality of Candida albicans strains in Taiwan / J Clin Microbiol 44 : 2172 ~ 2178 google schola Chowdhary A / 2006 / Comparison of multilocus sequence typing and Ca3 fingerprinting for molecular subtyping epidemiologically-related clinical isolates of Candida albicans google schola

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