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저자정보
저널정보
대한병리학회 Journal of Pathology and Translational Medicine Journal of Pathology and Translational Medicine 제48권 제1호
발행연도
2014.1
수록면
36 - 42 (7page)

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Background: Because of recent advances in the molecular diagnosis of cancer patients, tissue quality has become more important in daily practice. Methods: To evaluate the effects of fixative, duration of fixation, decalcification, and storage periods on nucleic acid integrity, DNA and RNA were extracted from gastrointestinal cancer tissue. The yield and purity were analyzed, and polymerase chain reaction (PCR) for glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH; 60 bp), β-actin (148 bp), and human growth hormone (hGH; 434 bp) and real-time reverse transcription-PCR for β-actin (97 bp) were performed. Results: All formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) and methacarn-fixed paraffin-embedded (MFPE) samples tested positive for GAPDH and β-actin by PCR. hGH was successfully detected in all MFPE samples, but in only 46.7% of the FFPE samples. Prolonged formalin fixation resulted in fewer GAPDH and β-actin PCR products, andamplification of hGH was not successful. The PCR and reverse transcription-PCR results were significantly affected by the duration of decalcification. The yield, purity, and integrity of mRNA progressively decreased with increased storage periods of paraffin blocks. Conclusions: Fixation and storage should therefore be standardized in order to improve the quality of molecular pathologic diagnosis.
#Nucleic acid preservation #Fixation procedures #Storage time

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