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자료유형
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저자정보
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제36권 제2호
발행연도
2009.1
수록면
130 - 136 (7page)

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벼는 국내에서 가장 중요한 식량작물로 게놈 크기가 389Mb이 며 식물 유전자 기능분석을 위한 모델 작물이다. 종자 발달과정에 관여하는 유전자의 기능을 분석하기 위하여 일품벼의 미숙종자(출 수 후 20일)의 발현유전자의 염기서열을 결정하였다. 염기서열이 결정된 25,668개의 발현유전자를 SeqMan 프로그램을 이용하여 cluster를 분석하여 7,509개의 unigene을 분리하였다. 일본 농업생물 자원연구소의 완전장 cDNA 32,127 클론 (KOME)과 미숙종자 발현 cDNA 7,509개를 비교분석 한 결과 4,990개는 일본의 클론과 일치 하였으며 2,519개 클론은 상동성을 나타내지 않았다. 미숙종자발 현 7,509개 unigene을 TIGR Pseudomolecule ver. 5의 염색체에 mapping 한 결과 7,347개는 각 염색체에 mapping되었으며 162개는 mapping되지 않았다. 미숙종자발현 7,509개 유전자의 기능을 NCBI COG DB를 이용 하여 분류한 결과 정보축적 및 처리 기능관련유전자 14.8%, 세포 생리기능관련 유전자 28.3%, 대사관련 유전자 21.2% 그리고 기능 미확인 유전자 35.7%의 비율을 나타내었다.

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Ammiraju JS / 2008 / Dynamic evolution of oryza genomes is revealed by comparative genomic analysis of a genus-wide vertical data set / Plant Cell. 20 : 3191 ~ 3209 google schola Carninci P / 1996 / High-efficiency full-length cDNA cloning by biotinylated CAP trapper / Genomics 37 : 327 ~ 336 google schola Doi K / 2008 / Development of a novel data mining tool to find cis-elements in rice gene promoter regions / BMC Plant Biol. 8 : 20 ~ google schola International Rice Genome Sequencing Project / 2005 / The mapbased sequence of the rice genome / Nature 436 : 793 ~ 800 google schola Jung KH / 2008 / Towards a better bowl of rice: assigning function to tens of thousands of rice genes / Nat Rev Genet. 9 : 91 ~ 101 google schola

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