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자료유형
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저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제44권 제9호
발행연도
2011.1
수록면
578 - 583 (6page)

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Aspartate aminotransferase (AST) and alanine aminotransferase (ALT) are biochemical markers used to test for liver diseases. Copy number variation (CNV) plays an important role in determining complex traits and is an emerging area in the study various diseases. We performed a genome-wide association study with liver function biomarkers AST and ALT in 407 unrelated Koreans. We assayed the genome-wide variations on an Affymetrix Genome-Wide 6.0 array, and CNVs were analyzed using HelixTree. Using single linear regression, 32 and 42 CNVs showed significance for AST and ALT, respectively (P value ＜ 0.05). We compared CNV-based genes between the current study (KARE2; AST-140, ALT-172) and KARE1(AST-1885, ALT-773) using NetBox. Results showed 9 genes (CIDEB, DFFA, PSMA3, PSMC5, PSMC6, PSMD12, PSMF1,SDC4, and SIAH1) were overlapped for AST, but no overlapped genes were found for ALT. Functional gene annotation analysis shown the proteasome pathway, Wnt signaling pathway,programmed cell death, and protein binding. [BMB reports 2011; 44(9): 578-583]
#ALT #AST #Copy number #Liver #Meta-analysis

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Armengol, C / 2009 / Wnt signaling and hepatocarcinogenesis: The hepatoblastoma model / Int. J. Biochem. Cell Biol 43 : 265 ~ 270 google schola Beckmann, J / 2007 / Copy number variants and genetic traits: closer to the resolution of phenotypic to genotypic variability / Nat. Rev. Genet 8 : 639 ~ 646 google schola Blaschke, T / 1977 / Protein binding and kinetics of drugs in liver diseases / Clin. Pharmacokinet 2 : 32 ~ 44 google schola Clemenz, M / 2008 / Liver-Specific Peroxisome Proliferator- Activated Receptor ￥a Target Gene Regulation by the Angiotensin Type 1 Receptor Blocker Telmisartan / Diabetes 57 google schola Cohen, J / 1979 / The SGOT/SGPT ratio-- an indicator of alcoholic liver disease / Dig. Dis. Sci 24 : 835 ~ 838 google schola

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