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자료유형
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저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제45권 제1호
발행연도
2012.1
수록면
47 - 50 (4page)

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The International HapMap Project and the Human Genome Diversity Project (HGDP) provide plentiful resources on human genome information to the public. However, this kind of information is limited because of the small sample size in both databases. A Genome-Wide Association Study has been conducted with 8,842 Korean subjects as a part of the Korea Association Resource (KARE) project. In an effort to build a publicly available browsing system for genome data resulted from large scale KARE GWAS, we developed the KARE browser. This browser provides users with a large amount of single nucleotide polymorphisms (SNPs) information comprising 1.5 million SNPs from population-based cohorts of 8,842 samples. KAREBrowser was based on the generic genome browser (GBrowse), a webbased application tool developed for users to navigate and visualize the genomic features and annotations in an interactive manner. All SNP information and related functions are available at the web site http://ksnp.cdc. go.kr/karebrowser/. [BMB reports 2012; 45(1): 47-50]
#Database #GWAS #Human genome #SNP

목차

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참고문헌 (11)

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Cho, Y. S. / 2009 / A large-scale genome-wide association study of Asian populations uncovers genetic factors influencing eight quantitative traits / Nature Genet. 41 (5) : google schola International HapMap Consortium / 2003 / The International HapMap Project / Nature 426 : 789 ~ 796 google schola Kato, N. / 2011 / Meta-analysis of genome-wide association studies identifies common variants associated with blood pressure variation in east Asians / NATURE GENETICS 43 (6) google schola Kim, Y. J. / 2011 / Large-scale genome-wide association studies in east Asians identify new genetic loci influencing metabolic traits / NATURE GENETICS 43 (10) : 990 ~ U102 google schola Koike, A. / 2009 / Genome-wide association database developed in theJapanese Integrated Database Project / J. Hum. Genet. 54 : 543 ~ 546 google schola

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