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저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제44권 제10호
발행연도
2011.1
수록면
680 - 685 (6page)

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The AT-hook motif is a small DNA-binding protein motif that has been found in the high mobility group of non-histone chromosomal proteins. The Arabidopsis genome contains 29genes encoding the AT-hook motif DNA-binding protein (AHL). Recent studies of Arabidopsis genes (AtAHLs) have revealed that they might play diverse functional roles during plant growth and development. In this report, we mined 20AHL genes (OsAHLs) from the rice genome database using AtAHL genes as queries and characterized their molecular features. A phylogenetic tree revealed that OsAHL proteins can be classified into 2 evolutionary clades. Tissue expression pattern analysis revealed that all of the OsAHL genes might be functionally expressed genes with 3 distinct expression patterns. Nuclear localization analysis using transgenic Arabidopsis showed that several OsAHL proteins are exclusively localized in the nucleus, indicating that they may act as architectural transcription factors to regulate expression of their target genes during plant growth and development. [BMB reports 2011; 44(10): 680-685]
#AT-hook motif DNA-binding protein #Light #Nuclear localization #Rice #Tissue expression

목차

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Aravind, L / 1998 / AT-hook motifs identified in a wide variety of DNA-binding proteins / Nucleic Acids Res 26 : 4413 ~ 4421 google schola Fujimoto, S / 2004 / Identification of a novel plant MAR DNA binding protein localized on chromosomal surfaces / Plant Mol. Biol 56 : 225 ~ 239 google schola Grasser,K.D / 2003 / Chromatin-associated HMGA and HMGB proteins: versatile co-regulators of DNA-dependent processes / Plant Mol. Biol 53 : 281 ~ 295 google schola Gupta, R / 1997 / Chromosomal location and expression of the single-copy gene encoding high-mobility-group protein HMG-I/Y in Arabidopsis thaliana / Plant Mol. Biol 34 : 529 google schola Gupta, R / 1998 / Characterization and promoter analysis of the Arabidopsis gene encoding high-mobility-group protein HMG-I/Y / Plant Mol. Biol 36 : 897 ~ 907 google schola

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