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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제43권 제12호
발행연도
2010.1
수록면
836 - 841 (6page)

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In the era of personal genomics, predicting the individual response to drug-treatment is a challenge of biomedical research. The aim of this study was to validate whether interaction information between genetic and transcriptional signatures are promising features to predict a drug response. Because drug resistance/susceptibilities result from the complex associations of genetic and transcriptional activities, we predicted the inter-relationships between genetic and transcriptional signatures. With this concept, captured genetic polymorphisms and transcriptional profiles were prepared in cancer samples. By splitting ninety-nine samples into a trial set (n = 30) and a test set (n = 69), the outperformance of relationship-focused model (0.84 of area under the curve in trial set, P = 2.90 × 10-4) was presented in the trial set and validated in the test set, respectively. The prediction results of modeling show that considering the relationships between genetic and transcriptional features is an effective approach to determine outcome predictions of drug-treatment.

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