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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2016.1
- 수록면
- 969 - 982 (14page)
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최근 천연물로부터 신약 후보물질을 개발하려는 연구가 활발히 이루어지고 있다. 인체 내에서 천연물은 주로 효소에 의해 대사된다. 본 연구는 화합물의 인체내 대사반응과 주로 관련된 효소에 의한 대사반응의 특징을 연관규칙마이닝을 활용하여 분석한다. 화합물이 인체 내에서 효소 대사반응과 관련된 데이터를 BRENDA로부터 수집하였다. 수집된 데이터를 효소대사반응의 기본 틀에 근거하여, 대사물들을 기질대사물, 생성대사물, 엑제대사물, 그리고 활성대사물들로 구분한다. 이러한 대사물들로 이루어진 기질대사물 트랜잭션, 생성대사물 트랜잭션, 그리고 모든 대사물들을 포함한 효소반응트랜잭션들을 구성하였다. 또한 종 정보를 반영한 6개의 트랜잭션들로 구성하였다. 연관규칙 마이닝을 활용하여 6개의 트랜잭션에서 빈발대사물 및 패턴을 분석하였다. 또한 대사물들 사이의 관련성을 분석하였다. 그 결과 효소대사반응에 참여하는 대사물들의 분포와 패턴을 식별할 수 있었다. 더욱이 기질에만 속하는 순수 기질대사물들을 식별하였고 이들 대부분이 아주 낮은 지지도임을 확인할 수 있었다. 연구결과는 순수 기질대사물은 효과적인 대사변환 예측 모델 개발에 활용될 수 있다.
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참고문헌 (17)
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A. Tarca / 2007 / Machine Learning and Its Applications to Biology / J. of Public Library of Science(PLOS) Computational Biology 3(6):953~963
K. Park / 2015 / Predicting pharmacodynamic drug-drug interactions through signaling propagation interference on protein-protein interaction networks / J. of Public Library of Science(PLOS) ONE 10:e0140816
J. Seum / 2015 / Prediction of Compound-Target Interactions of Natural Products Using Large-scale Drug and Protein Information / Proc. of the ACM Ninth Int. Workshop on Data and Text Mining in Biomedical Informatics :15
석경휴 / 2011 / 바이오 셀 정보 추출을 위한 확률 모델 / 한국전자통신학회 논문지 6(5):649~656
김광준 / 2011 / 압타머 단백질 바이오칩을 이용한 간암 진단 생체 정보 예측 시스템 개발 / 한국전자통신학회 논문지 6(6):965~971
K. Park / 2015 / Predicting pharmacodynamic drug-drug interactions through signaling propagation interference on protein-protein interaction networks / J. of Public Library of Science(PLOS) ONE 10:e0140816
J. Seum / 2015 / Prediction of Compound-Target Interactions of Natural Products Using Large-scale Drug and Protein Information / Proc. of the ACM Ninth Int. Workshop on Data and Text Mining in Biomedical Informatics :15
석경휴 / 2011 / 바이오 셀 정보 추출을 위한 확률 모델 / 한국전자통신학회 논문지 6(5):649~656
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