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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
김만선 (충남대학교) 임용표 (충남대학교)
저널정보
한국지능시스템학회 한국지능시스템학회 논문지 한국지능시스템학회 논문지 제29권 제1호
발행연도
2019.2
수록면
36 - 41 (6page)
DOI
10.5391/JKIIS.2019.29.1.36

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배추(Brassica rapa ssp. pekinensis)는 김치의 주재료로 우리의 식생활에서 빼놓을 수 없는 채소이며, 중국·일본과 함께 동양 3국에서 중요한 채소 중 하나이다. 배추의 다양한 조직을 구성하는 세포 내에 존재하는 유전자들의 조절 관계를 파악하는 것은 배추의 발달과정을 이해하는데 필수적이다. 다세포 생명체의 발달 과정 동안 개별 조직 내 세포의 상태와 외부 환경에 따라서 물리적으로 존재하는 모든 유전자와 이들 사이에 가능한 모든 상호작용 중, 일부 유전자와 그 상호작용만이 부분적, 선택적으로 활성화된다. 그러므로, 배추의 발달 과정을 이해하기 위해서는 조직별·선택적으로 활성화되는 유전자 조절 네트워크를 규명하는 연구가 필요하다. 우리는 배추의 대표적인 조직인 꽃 (flower)에 대해 부분 네트워크를 동정하고, 이것의 기능적 특징을 밝히고자 한다. 우선, 1) 조직 특이적으로 발현되는 유전자를 선별하고, 2) 알려진 유전자 조절 네트워크를 통해 선별된 유전자를 적용하여 부분 네트워크를 재구성하였다. 3) 우리는 발굴된 부분 네트워크에서 기능적 최소 단위인 네트워크 모티프를 동정하였다. 그 결과, 피드포워드(FFL: feedforward) 모티프가 가장 지배적인 구조임을 밝혀냈고 이들의 세부 구조에 대한 특성을 알아보았다. 종합적으로, 꽃 조직은 coherent FFL와 incoherent FFL의 조합으로 구성되어 있다는 것을 확인했다. coherent FFL 구조는 꽃 조직으로 하여금 안정적인 개화 반응을 유도할 수 있게 하며, 반면에 incoherent FFL 구조는 외부 환경 변화에 빠르게 적응(adaptation)하여, 항상성 (homeostasis)을 유지하려는 특성의 원천이 될 것으로 여겨진다.
#유전자 조절 네트워크 #배추 #시스템 생물학 #네트워크 모티프 #Gene Regulatory Network #Brassica rapa #Systems biology #Network motif

목차

요약
Abstract
1. 서론
2. 분석 방법
3. 결과 및 토의
4. 결론
References

참고문헌 (22)

참고문헌 신청
M .S. Kim, et al., “Identification and characterization of the leaf specific networks of inner and rosette leaves in Brassica rapa”, Biochem Biophys Res Commun, 490,pp.821-826, 2017. google schola J.-R.K. Man-Sun Kim, Yong Pyo Lim, “Characterization of the tissue specific networks inB rassica rapa”, Journal of Korean Institute of Intelligent Systems, 28, pp.507-513, 2018. google schola T. Hu, et al., “Genome-wide identification and characterization of CONSTANS-like gene family in radish (Raphanus sativus)”, PLoS One, 13,e0204137, 2018. google schola J. Jin, et al., “An Arabidopsis Transcriptional Regulatory Map Reveals Distinct Functional and Evolutionary Features of Novel Transcription Factors”, Mol Biol Evol, 32 ,pp.1767-1773, 2015. google schola L.T. Macneil, A.J. Walhout, “Gene regulatory networks and the role of robustness and stochasticity in the control of gene expression”, Genome Res, 21, pp.645-657, 2011. google schola

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