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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2014.10
- 수록면
- 1,057 - 1,067 (11page)
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인간게놈 프로젝트 이후 질병과 연관된 변이유전자를 탐색하기 위해 유전형질의 차이에 영향을 주는 단일 유전자를 중심으로 전장유전체 연관성 연구가 활발하게 진행되어왔다. 그러나 전장유전체 연관성 연구에서 접근한 단일유전자 분석방법에 한계점이 발견되면서 최근에는 다중유전자 분석방법이나 유전자-유전자간의 상호작용에 대한 연구들이 활발하게 진행 중이다. 이 중 다중차원축소방법은 유전자-유전자간의 상호작용의 연관성을 찾아내기 위하여 고차원을 일차원으로 축소하는 방법으로 이진형 반응변수를 기반으로 크게 활용되고 있다. 본 논문에서는 이 방법을 생존시간으로 확장하여 생존시간과 연관된 유전자-유전자간의 상호작용을 찾아내는 방법을 제안하고자 한다. 구체적으로 가속화 고장시간 회귀모형 하에서 표준화잔차 스코어를 분류기준으로 사용하여 다중차원축소방법을 적용하는 방법으로 AFT-MDR이라고 지칭하였다. 시뮬레이션 연구를 통하여 기존에 제안된 Surv-MDR과 Cox-MDR과의 검정력을 비교하였으며 국내의 백혈병환자 자료분석에 적용하였다. 시뮬레이션 결과로부터 AFT-MDR은 유전율이 높을수록 검정력이 커지며 회귀모형에 기반하여 공변량의 효과를 고려할 수 있다는 장점이 있으나 센서링 비율이 높아지면서 검정력이 매우 떨어진다는 단점이 발견되었다. 따라서 이를 보완하기 위한 추후연구의 필요성이 요구된다.
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1. [학술지(정기간행물)] - Gui, J. / 2011 / A novel survival multifactor dimensionality reduction method for detecting gene-gene interactions with application to bladder cancer prognosis / Human Genetics 129 : 101 ~ 110
2. [학술지(정기간행물)] - Lee, S. Y. / 2012 / Gene-gene interaction analysis for the survival phenotype based on the martingale residuals / Bioinformatics 28 : 582 ~ 588
3. [학술지(정기간행물)] - Lou, X. Y. / 2007 / A generalized combinatorial approach for detecting gene-by-gene and gene-by-environment interactions with application to nicotine dependence / American Journal of Human Genetics 80 : 1125 ~ 1137
4. [학술지(정기간행물)] - Ritchie, M. D. / 2001 / Multifactor-dimensionality reduction reveals high-order interactions among estrogen-metabolism genes in sporadic breast cancer / American Journal of Human Genetics 69 : 138 ~ 147
5. [학술지(정기간행물)] - Velez, D. R. / 2007 / A balanced accuracy function for epistasis modeling in imbalanced datasets using multifactor dimensionality reduction / Genetic Epidemiology 31 : 306 ~ 315
2. [학술지(정기간행물)] - Lee, S. Y. / 2012 / Gene-gene interaction analysis for the survival phenotype based on the martingale residuals / Bioinformatics 28 : 582 ~ 588
3. [학술지(정기간행물)] - Lou, X. Y. / 2007 / A generalized combinatorial approach for detecting gene-by-gene and gene-by-environment interactions with application to nicotine dependence / American Journal of Human Genetics 80 : 1125 ~ 1137
4. [학술지(정기간행물)] - Ritchie, M. D. / 2001 / Multifactor-dimensionality reduction reveals high-order interactions among estrogen-metabolism genes in sporadic breast cancer / American Journal of Human Genetics 69 : 138 ~ 147
5. [학술지(정기간행물)] - Velez, D. R. / 2007 / A balanced accuracy function for epistasis modeling in imbalanced datasets using multifactor dimensionality reduction / Genetic Epidemiology 31 : 306 ~ 315
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