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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2015.2
- 수록면
- 1,563 - 1,570 (8page)
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본 연구는 올리고펩티드의 연쇄성장 과정에서의 배좌의 변화를 조사하기 위하여 알라닌 올리고머 모델의 2량체 부터 5량체 까지 양자화학 계산(QCC)에 의한 구조최적화 계산을 하였다. 말단기의 영향을 확인하기 위하여 N말단 및 C말단이 공히 amide 구조를 갖는 “amide type” (CH,<sub>3</sub>CONH-and-CONHCH<sub>3</sub>)과 N말단만이 methyl 구조를 갖는 “methyl type” (CH<sub>3</sub>NH-and-CONHCH<sub>3</sub>)의 2종류 모델을 준비하였다. 5량체 까지의 구조 최적화 계산 결과 3종류의 형태이성질체로 수렴이 되었다. 안정성이 높은 순서로 각각 α 나선형, PPII 유사형, β 확장형으로 나타났으며, 사슬회전 방향이 서로 반대인 형태이성 질체간의 에너지 값은 동일하게 나타났다 (5량체, “amide type” 좌?우회전형: ΔE=-1.05, “methyl type” 좌?우회전형: Δ E=-1.62). α 나선형의 모노머 단위당 에너지변화(ΔE)는 모노머의 증가와 함께 감소하였다.
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참고문헌 (10)
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1. [학술지(정기간행물)] - Jürgen Graf / 2007 / Structure and Dynamics of the Homologous Series of Alanine Peptides: A Joint Molecular Dynamics/NMR Study / Journal of the American Chemical Society 129 (5) : 1179 ~ 1189
2. [학술지(정기간행물)] - Noemi G. Mirkin / 2007 / Conformation Dependence of the CαDα Stretch Mode in Peptides. I. Isolated Alanine Peptide Structures / The Journal of Physical Chemistry A 111 (24) : 5300 ~ 5303
3. [학술지(정기간행물)] - Alex Kentsis / 2004 / Unfolded state of polyalanine is a segmented polyproline II helix / Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 55 (3) : 493 ~ 501
4. [학술지(정기간행물)] - Minoru KOBAYASHI / 2007 / Examination of Conformations of Isotactic Methyl Methacrylate Oligomers by Quantum Chemical Calculation / KOBUNSHI RONBUNSHU 64 (2) : 119 ~ 127
5. [학술지(정기간행물)] - Minoru Kobayashi / 2008 / Conformational Analysis of Ethylene Oxide and Ethylene Imine Oligomers by Quantum Chemical Calculation / Polymer Journal 40 (4) : 343 ~ 349
2. [학술지(정기간행물)] - Noemi G. Mirkin / 2007 / Conformation Dependence of the CαDα Stretch Mode in Peptides. I. Isolated Alanine Peptide Structures / The Journal of Physical Chemistry A 111 (24) : 5300 ~ 5303
3. [학술지(정기간행물)] - Alex Kentsis / 2004 / Unfolded state of polyalanine is a segmented polyproline II helix / Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 55 (3) : 493 ~ 501
4. [학술지(정기간행물)] - Minoru KOBAYASHI / 2007 / Examination of Conformations of Isotactic Methyl Methacrylate Oligomers by Quantum Chemical Calculation / KOBUNSHI RONBUNSHU 64 (2) : 119 ~ 127
5. [학술지(정기간행물)] - Minoru Kobayashi / 2008 / Conformational Analysis of Ethylene Oxide and Ethylene Imine Oligomers by Quantum Chemical Calculation / Polymer Journal 40 (4) : 343 ~ 349
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