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본 연구에서는 상수리림 부식층으로부터 방향족 화합물(리그닌 polymers) 분해세균을 분리하여 계통학적 특성을 밝히고, pyrosequencing 계통분석을 통해 부식층 내 주요 세균군집과의 상관관계를 검토하고자 하였다. 방향족 화합물(p-anisic acid, benzoic acid, ferulic acid 및 p-coumaric acid)을 이용하는 세균 42균주를 분리하여 16S rRNA 계통해석한 결과, Rhizobium, Sphingomonas, Burkhorlderia, Pseudomonas 계통군으로 확인되었다. 이들 방향족화합물 분해세균 중 Burkhorlderia 계통군은 전체 분리균주의 83%로 높은 비율을 차지하였다. 차세대 염기서열 분석법(pyrosequencing)을 이용하여 부식층 시료로부터 7,862개의 16S rRNA 유전자 염기서열을 얻었으며, 유의성 97% 수준에서 1,821 OTUs와 다양성 지수 6.76가 확인되었다. 상수리림 부식층 내 세균군집은 총 22개 문(phylum)으로 구성되었으며, 주요 세균군집으로 확인된 β-proteobacteria 계통군은 Burkholderia, Polaromonas, Ralstoria, Zoogloea, Variovorax를 포함하는 15개 속으로 세분류 되었다. 이들 세균 중 약 50%가 Burkholderia 속으로 확인되었다. 상수리림 부식층 내 우점군집으로 밝혀진 Burkholderia 계통군은 산림 생태계에서 리그닌 분해 대사 과정에 중요한 미생물생태학적 역할을 수행하는 것으로 판단되었다.
목차
ABSTRACT
재료 및 방법
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References
참고문헌 (30)
참고문헌 신청
[단행본] - Alexander, M. / 1985 / Introduction to soil microbiology / John Wiley & Sons
[학술지(정기간행물)] - Baboshin, M. / 2008 / Conversion of polycyclic aromatic hydrocarbons by Sphingomonas sp. VKM B-2434 / Biodegradation 19 : 567 ~ 576
[학술지(정기간행물)] - Basu, A. / 2006 / Preferential utilization of aromatic compounds over glucose by Pseudomonas putida CSV86 / Appl. Environ. Microbiol 72 : 2226 ~ 2230
[학술지(정기간행물)] - Cole, J. R. / 2009 / The Ribosomal Database Project:improved alignments and new tools for rRNA analysis / Nucleic Acids Res 37 : 141 ~ 145
[학술지(정기간행물)] - Hackl, E. / 2005 / Composition of the microbial communities in the mineral soil under different types of natural forest / Soil Biol. Biochem 37 : 661 ~ 671
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[학술지(정기간행물)] - Basu, A. / 2006 / Preferential utilization of aromatic compounds over glucose by Pseudomonas putida CSV86 / Appl. Environ. Microbiol 72 : 2226 ~ 2230
[학술지(정기간행물)] - Cole, J. R. / 2009 / The Ribosomal Database Project:improved alignments and new tools for rRNA analysis / Nucleic Acids Res 37 : 141 ~ 145
[학술지(정기간행물)] - Hackl, E. / 2005 / Composition of the microbial communities in the mineral soil under different types of natural forest / Soil Biol. Biochem 37 : 661 ~ 671
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