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저자정보
Sang-Yong Eom (Chungbuk National University) Ji-Ae Lim (Dankook University College of Medicine) Yong-Dae Kim (Chungbuk National University) Byung-Sun Choi (Chung-Ang University College of Medicine) Myung Sil Hwang (National Institute of Food and Drug Safety Evaluation) Jung-Duck Park (Chung-Ang University College of Medicine) Heon Kim (Chungbuk National University) Ho-Jang Kwon (Dankook University College of Medicine)
저널정보
한국독성학회 Toxicological Research Toxicological Research Vol.32 No.3
발행연도
2016.7
수록면
195 - 205 (15page)

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This study was performed to select single nucleotide polymorphisms (SNPs) related to the body burden of heavy metals in Koreans, to provide Korean allele frequencies of selected SNPs, and to assess the difference in allele frequencies with other ethnicities. The candidate-gene approach method and genome-wide association screening were used to select SNPs related to the body burden of heavy metals. Genotyping analysis of the final 192 SNPs selected was performed on 1,483 subjects using the VeraCode Goldengate assay. Allele frequencies differences and genetic differentiations between the Korean population and Chinese (CHB), Japanese (JPT), Caucasian (CEU), and African (YIR) populations were tested by Fisher’s exact test and fixation index (F<SUB>ST</SUB>), respectively. The Korean population was genetically similar to the CHB and JPT populations (F<SUB>ST</SUB> < 0.05, for all SNPs in both populations). However, a significant difference in the allele frequencies between the Korean and CEU and YIR populations were observed in 99 SNPs (60.7%) and 120 SNPs (73.6%), respectively. Ten (6.1%) and 26 (16.0%) SNPs had genetic differentiation (F<SUB>ST</SUB> > 0.05) among the Korean-CEU and Korean-YIR comparisons, respectively. The SNP with the largest F<SUB>ST</SUB> value between the Korean and African populations was cystathionine-β-synthase rs234709 (F<SUB>ST</SUB>: KOR-YIR, 0.309; KOR-CEU, 0.064). Our study suggests that interethnic differences exist in SNPs associated with heavy metals of Koreans, and it should be considered in future studies that address ethnic differences in heavy-metal concentrations in the body and genetic susceptibility to the body burden of heavy metals.
#Genetic diversity #Single nucleotide polymorphism #Gene frequency #Metals

목차

INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
RESULTS
DISCUSSION
REFERENCES

참고문헌 (29)

참고문헌 신청
Jarup, L. / 2003 / Hazards of heavy metal contamination / Br. Med. Bull 68:167~182 google schola Tchounwou, P. B / 2012 / Heavy metal toxicity and the environment / EXS 101:133~164 google schola Christensen, J. M / 1995 / Human exposure to toxic metals:factors influencing interpretation of biomonitoring results / Sci. Total Environ 166:89~135 google schola Goyer, R. A. / 1995 / Nutrition and metal toxicity. Am / J. Clin. Nutr 61:646S~650S google schola Nordberg, G. F / 2014 / Handbook on the Toxicology of Metals / Academic Press google schola

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