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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Sang Chul Choi (Chungnam National University) Yong Suk Chung (Chungnam National University) Changsoo Kim (Chungnam National University)
저널정보
충남대학교 농업과학연구소 Korean Journal of Agricultural Science Korean Journal of Agricultural Science Vol.43 No.1
발행연도
2016.3
수록면
1 - 13 (13page)

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Climate changes are shifting the perception of C4 photosynthetic crops due to their superior adaptability to harsh conditions. The tribe Andropogoneae includes some economically important grasses, such as Zea mays, Sorghum bicolor, Miscanthus spp., and Saccharum spp., representing C4 photosynthetic grasses. Although the Andropogoneae grasses diverged fairly recently, their genomic structures are remarkably different from each other. As previously reported, the family Poaceae shares the pan-cereal duplication event occurring ca. 65 MYA. Since this event, Sorghum bicolor has never experienced any additional duplication event. However, some lineage-specific duplication events were reported in Z. mays and Saccharum spp., and, more recently, it was revealed that a shared allotetraploidization event occurred before the divergence between Miscanthus and Saccharum (but after the divergence from S. bicolor), which provided important clues to those two species having large genome sizes with complicated ploidy numbers. The complex genomic structures of sugarcane and Miscanthus (defined as the Saccharum complex along with some other taxa) have had a limiting effect on the use of their molecular information in breeding programs. For the last decade, genomics-associated technologies have become an important tool for molecular crop breeding (genomics-assisted breeding, GAB), but it has not been directly applied to sugarcane and Miscanthus due to their complicated genome structures. As genomics research advances, molecular breeding of those crops can take advantage of technical improvements at a reasonable cost through comparative genomic approaches. Active genomic research of non-model species using closely related model species will facilitate the improvement of those crops in the future.
#evolution #genomics-assisted breeding #panicoideae #poaceae #polyploidyzation

목차

Abstract
Introduction
Reference genomes of Andropogoneae
Comparative genomics approaches for larger-genome species
Sugarcane Genome Sequencing Initiative (SUGESI)
Use of genomics resources for future breeding efforts
Conclusion
References

참고문헌 (40)

참고문헌 신청
Abrouk M, Murat F, Pont C, Messing J, Jackson S, Faraut T, Tannier E, Plomion C, Cooke R, Feuillet C et al. 2010. Palaeogenomicsof plants: synteny-based modelling of extinct ancestors. google schola Arabidopsis Genome Initiative. 2000. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana.Nature 408:796-815. google schola Bremer G. 1961. Problems in breeding and cytology of sugarcane. Euphytica 10:59-78. google schola D'Hont A, Ison D, Alix K, Roux C, Glaszmann J-C. 1998. Determination of basic choromosome numbers in the genusSaccharum by physical mapping of ribosomal RNA genes. Genome 41:221-225. google schola Daniels J, Roach BT. 1987. Taxonomy and Evolution. in Sugarcane Improvement Through Breeding (ed. DJ Heinz),pp. 7-84. Elsevier Press, Amsterdam. google schola

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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2016-480-002738406