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한국컴퓨터정보학회 한국컴퓨터정보학회논문지 한국컴퓨터정보학회 논문지 제13권 제3호
발행연도
2008.5
수록면
35 - 44 (10page)

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본 논문에서는 SOA 기반의 EST 서열 주해 시스템인 SeqWeB을 제안한다. SeqWeB은 EST 서열 주해에 사용되는 8개의 분석 프로그램 (Phrap, cross_match, RepeatMasker, ICAtools, TGICL, CAP 3, Phrap, BLAST)을 웹 서비스로 제작하고, BPEL (Business Process Execution Language)을 통해 8개의 서비스를 다양한 형태로 조합한다. BPEL로 조합한 서비스들은 표준 데이터 형식으로 통신하여 통합 시 상호 운용성을 보장한다. SeqWeB은 웹 서비스와 BPEL을 통한 약 결합 방식으로 통합하여, 기존의 애플리케이션 통합 방식보다 시스템의 확장과 수정이 쉬우며 유지보수 비용이 저렴하다. 또한, SeqWeB은 다른 서비스의 컴포넌트로 사용될 수도 있다. SeqWeB을 통해 SOA가 지향하는 재사용성(Reusability)과 유연성 (Flexible)을 기반으로 기존과 다른 방식의 생물학 분야의 애플리케이션 통합방법론을 제시한다.
#서비스 지향 구조 #웹 서비스 #EST 서열 주해 #Service Oriented Architecture #Web services #BPEL #EST sequence annotation

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1. [학술지(정기간행물)] - Adams,M..D / 1991 / Complementary DNA sequencing: expressed sequence tags and human genome project / Science 252 : 1651 ~ 1661 google schola 2. [단행본] - Parkinson,J / 2004 / Parasite Genome Protocols Humana Press / Totowa,N.J google schola 3. [학술지(정기간행물)] - Ewing,B.,et al / 1998 / Base-calling of automated sequencer traces using phred. I. Accuracy assessment / Genome Res 8 : 175 ~ 185 google schola 4. [학술지(정기간행물)] - Pertea,G / 2003 / TIGR Gene Indices Clustering Tools (TGICL): a software system for fast clustering of large EST datasets / Bioinformatics 19 : 651 ~ 652 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - Altschul,S.F / 1997 / Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs / Nucleic Acids Res 25 : 3389 ~ 3402 google schola

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