수청바이러스의 M, L 분절의 염기서열 및 계통 분석

김은주; 문성실; 송기준; 송진원; 박광숙; 백락주

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자료유형: 학술저널

저자정보: 김은주 (고려대학교) 문성실 (고려대학교) 송기준 (고려대학교) 송진원 (고려대학교) 박광숙 (고려대학교) 백락주 (고려대학교)

저널정보: 대한바이러스학회 JOURNAL OF BACTERIOLOGY AND VIROLOGY Journal of Bacteriology and Virology 제37권 제2호

발행연도: 2007.6

수록면: 111 - 118 (8page)

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Hantaan virus (HTNV) and Seoul virus (SEOV) have mainly been known as the cause of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) in Korea since HTNV has been isolated from Korean field mouse, Apodemus agrarius in 1976 and SEOV has been isolated from Rattus norvegicus in 1980. Soochong virus-1, -2, -3, -4 (SOOVs) were isolated from lung tissues of four Apodemus peninsulae captured on August 1997 at Mt. Gyebang in Hongcheon-gun, Mt. Gachil, Inje-gun, Gangwon Province, and in September 1998 at Mt. Deogyu, Muju-gun, Jeollabuk Province. Apodemus peninsulae is the second-most dominant field rodent species found throughout Korea. To determine phylogenetic analysis of SOOVs, we entirely identified nucleotide sequences of M and L segments. The length of M segment was 3,615 bp and L segment was 6,533 bp. SOOVs were diverged from HTNV by 22.7~23.3% and SEOV by 36.3~37.2%, in M segment. In addition, L segment was diverged from HTNV by 21.8~22.0% and SEOV by 30.3~30.5%. SOOVs sequence compared with Amur virus (AMRV) in M segment showed that SOOVs were different with AMRV about 14.6~16.2% in nucleotide sequences. Neighbor-joining phylogenetic analysis based on entire sequences of the M and L segment indicated that the SOOVs sequences present a separate lineage with HTNV, SEOV and AMRV. SOOVs constituted an individual cluster on the phylogenetic tree and they composed a phylogenic lineage separately. According to these data, SOOVs could be classified as a new hantavirus.

#Hantavirus #Soochong virus #Apodemus peninsulae

참고문헌 (20)

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1. [학술지(정기간행물)] - 백락주 / 1997 / 1995년 계방산에서 채집한 들쥐의 한타바이러스 감염에 대한 혈청학적 연구 27 (2) : 177 ~ 183

2. [학술지(정기간행물)] - 송기준 / 2000 / Isolation of Apodemus peninsulae-borne Hantanvirus and comparison of molecular biological characteristics 30 (1) : 19 ~ 28

3. [학술지(정기간행물)] - 정수용 / 2005 / 신종 수청바이러스와 무주바이러스의 혈청학적 특성 35 (3) : 225 ~ 249

4. [학술지(정기간행물)] - Avsic-Zupanc T / 1992 / Characterization of Dobrava virus: a Hantavirus from Slovenia, Yugoslavia 38 : 132 ~ 137

5. [학술지(정기간행물)] - Baek LJ / 2006 / An antigenically and genetically distinct hantavirus isolated from Apodemus peninsulae in Korea 78 (2) : 290 ~ 297

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