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본 연구에서는 차세대염기서열분석법(Next Generation Sequencing)을 이용하여 상업적으로 농가에 가장 많이 보급되어 있는 요크셔와 랜드레이스를 포함한 두 종의 장내미생물생태분석을 실시하였다. 박테리아의 16S rRNA 유전자는 분변샘플로부터 추출한 DNA에서 V4 지역을 증폭할 수 있도록 디자인된 유니버설 프라이머 세트를 이용하여 증폭되었다. 두 종에 대한 장내미생물생태 비교분석은 성장단계에 따라 차이를 보이는 반면, 종에 따른 차이는 거의 없다는 것을 확인하였다. 하지만, 두 종간의 장내미생물생태 내에서 특정 미생물의 수가 차이가 있다는 것을 확인하였다. 요크셔는 특히 섬유질 소화를 통해 에너지생산률을 높여준다고 보고된 바가 있는 Xylanibacter 속(Genus)의 미생물을 많이 포함하는 것으로 나타났다. 또한, 랜드레이스는 숙주 내에서 면역에 중요한 역할을 하는 것으로 알려진 Clostridium_IV 종을 상당히 많이 포함하는 것으로 나타났으며, 반면 요크셔는 기회감염미생물들을 많이 포함하는 것으로 나타났다.
본 연구는 요크셔와 랜드레이스를 포함한 두 종간의 장내미생물생태 비교분석을 통해 그 차이점이 종에 의한 차이보다는 성장단계에 따라 큰 차이가 있다는 것을 확인하였다. 하지만 두 종 사이에서 성장에 영향을 미칠 가능성이 있는 몇 장내미생물의 수가 차이가 있다는 것을 확인하였다.
본 연구는 요크셔와 랜드레이스를 포함한 두 종간의 장내미생물생태 비교분석을 통해 그 차이점이 종에 의한 차이보다는 성장단계에 따라 큰 차이가 있다는 것을 확인하였다. 하지만 두 종 사이에서 성장에 영향을 미칠 가능성이 있는 몇 장내미생물의 수가 차이가 있다는 것을 확인하였다.
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참고문헌 (28)
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2. [학술지(정기간행물)] - Caporaso, J.G. / 2012 / Ultra-high-throughput microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq platforms / ISME J 6 : 1621 ~ 1624
3. [학술지(정기간행물)] - Casewell, M. / 2003 / The European ban on growth-promoting antibiotics and emerging consequences for human and animal health / J. Antimicrob. Chemother 52 : 159 ~ 161
4. [학술지(정기간행물)] - Castillo, M. / 2006 / The response of gastrointestinal microbiota to avilamycin, butyrate, and plant extracts in early-weaned pigs / J. Anim. Sci 84 : 2725 ~ 2734
5. [학술지(정기간행물)] - Cole, J.R. / 2009 / The Ribosomal Database Project:improved alignments and new tools for rRNA analysis / Nucleic Acids Res 37 : D141 ~ D145
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