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논문 기본 정보

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학술대회자료
저자정보
박승현 (고려대학교) 윤성로 (서울대학교)
저널정보
대한전자공학회 대한전자공학회 학술대회 2013년도 대한전자공학회 추계종합학술대회
발행연도
2013.11
수록면
802 - 805 (4page)

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Sequence Alignment is one of the fundamental tasks in genome studies. It allows to measure distance between sequences, precisely. On the other hand, the drawback of alignment-based measurement is the high time complexity and it can be very time-consuming for a long sequence. To overcome this issue, a lot of researches have been carried out to alignment-free distance measurement. However, there has been lack of practical comparison among various distance measurement methods. In this paper, we compare alignment-free distance measurement methods that are widely used such as Base-Base Correlation(BBC), Feature Frequency Profiles(FFPs) with the seqeuncing distance measurent methods such as Improved Complete Composition Vectors(ICCVs). Also, we determine the qualification as distance measurement metric and look into the limitations of each algorithm.

목차

Abstract
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 관련연구
Ⅲ. 실험방법
Ⅳ. 실험결과
Ⅳ. 결론 및 향후 연구 방향
참고문헌

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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2015-560-001004835