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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2013.10
- 수록면
- 137 - 145 (9page)
- DOI
- 10.14801/kiitr.2013.11.10.137
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Emulab은 연구와 교육을 위해 구성된 에뮬레이션 기반 네트워크 테스트베드이다. 지금까지는 정보보호와 네트워크 연구를 위해 주로 사용되고 있지만 연구 분야를 병렬처리로 활용 분야를 점점 더 넓혀가고 있다. 생물정보학(bio-informatics)의 유전자 검색은 생물정보학 연구에 중요한 부분이다. 이와 같은 연구는 컴퓨터를 이용하여 수행되고 있는데 특히 병렬처리를 통해 연구 기간을 단축시키고 있다. mr-mpi-blast는 유전자 검색을 위해 DNA서열 정렬을 병렬화하는 도구이다. 본 연구에서는 Emulab 상에 mr-mpi-blast 연구 환경을 구축하고 NCBI에서 제공하는 데이터베이스로 서열 정렬을 수행하였다. Emulab은 CPU의 개수를 증가함에 따라 mrmpi-blast의 성능이 비례하여 개선되었고 미국 Genepool에 비해서도 나은 성능을 보여 주었다. 실험을 통하여 Emulab은 BLAST 연구를 위한 연구 환경으로 효과적이라는 사실을 알 수 있었다.
목차
요약
Abstract
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 관련연구
Ⅲ. 연구 환경 구축 및 사용 방법
Ⅳ. 실험 결과
Ⅴ. 결론
References
참고문헌 (14)
참고문헌 신청
1. [학술대회논문] - Mike Hibler. / 2008 / Large-scale Virtualization in the Emulab Network Testbed / In Proceedings of the 2008 USENIX Annual Technical Conference : 113 ~ 128
2. [인터넷자원] - / / http://www.emulab.kreonet.net
3. [학술지(정기간행물)] - S. F. Altschul. / 1990 / Basic Local Alignment Search Tool / Journal of Molecular Biology 215 (3) : 403 ~ 410
4. [인터넷자원] - / / ftp://ftp.ncbi.nih.gov
5. [학술대회논문] - J. Dean. / 2010 / MapReduce : A Flexible Data Processing Tool / CACM 53 : 72 ~ 77
2. [인터넷자원] - / / http://www.emulab.kreonet.net
3. [학술지(정기간행물)] - S. F. Altschul. / 1990 / Basic Local Alignment Search Tool / Journal of Molecular Biology 215 (3) : 403 ~ 410
4. [인터넷자원] - / / ftp://ftp.ncbi.nih.gov
5. [학술대회논문] - J. Dean. / 2010 / MapReduce : A Flexible Data Processing Tool / CACM 53 : 72 ~ 77
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