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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
이보람 (서울대학교) 김진우 (서울대학교) 김병기 (서울대학교)
저널정보
한국생물공학회 KSBB Journal KSBB Journal 제26권 제4호
발행연도
2011.8
수록면
352 - 356 (5page)

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The detection of biomarkers is an important issue for disease diagnosis. However, many systems are not suitable to detect the biomarker itself directly. For direct detection of biomarker proteins in human serum, a new affinity-capture method using aptamers combined with the mass spectrometry was suggested. Since signals from protein samples cannot be amplified, modified chromatin immunoprecipitation (ChIP) and subsequent cross-linking with formaldehyde between aptamers and target proteins were used not to lose the captured target proteins, which allowed us to perform a harsh washing step to remove the non-specifically bound proteins. As a model system, a thrombin aptamer was used as a bait and thrombin as a target protein. Using our modified ChIP and affinity-capture method, non-specific binding proteins on the beads decreased significantly, suggesting that our new method is efficient and can be applied to developing diagnosis systems for various biomarkers.
#aptamer biomarker #formaldehyde #cross-linking #MS analysis #magnetic beads

목차

Abstract
1. 서론
2. 재료 및 방법
3. 결과 및 고찰
4. 결론
References

참고문헌 (15)

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1. [학술지(정기간행물)] - Tuerk, C / 1990 / Systematic evolution of ligands by expenential enrichment: RNA ligands to bicteriophage T4 DNA polymerase / Science 249 : 505 ~ 510 google schola 2. [학술지(정기간행물)] - Ellington, A. D / 1990 / In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands / Nature 346 : 818 ~ 822 google schola 3. [학술지(정기간행물)] - Ciesiolka, J / 1995 / Selection of an RNA domain that binds Zn2+ / RNA 1 : 538 ~ 550 google schola 4. [학술지(정기간행물)] - Ma, C / 2010 / An aptamer-based and pyrene-labeled fluorescent biosensor for homogeneous detection of potassium ions / Anal. Sci 26 : 1261 ~ 1264 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - Sassanfar, M / 1993 / An RNA motif that binds ATP / Nature 364 : 550 ~ 553 google schola

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