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저자정보
김경우 (고려대학교) 윤권찬 (고려대학교) 김재인 (고려대학교) 이명상 (고려대학교) 엄길호 (연세대학교) 나성수 (고려대학교)
저널정보
대한기계학회 대한기계학회 춘추학술대회 대한기계학회 2012년도 추계학술대회 논문집
발행연도
2012.11
수록면
555 - 558 (4page)

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2013

분자동역학 기법을 이용한 아밀로이드 단백질의 기계역학적 특성 연구
김경우 機械工學科 2013.01 학위논문

2012

분자 동역학 기법을 이용한 아밀로이드 단백질의 구조적 특성 연구
김경우 ,  윤권찬 ,  김재인 외 3명 대한기계학회 춘추학술대회 2012.11 학술대회자료

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Amyloid fibrils are self-assembly and self-aggregated molecular structure related to the fatal diseases such as Alzheimer’s disease, Parkinson’s disease, and type ?? diabetes. The β2-microglobulin (β₂m) is one of the amyloid fibrils, which induce devastating effects of dialysis-related amyloidosis. It deposits as amyloid fibrils within joints during long-term hemodialysis treatment. The molecule structure of the β₂m is concerned with experimental research. It has 99 residues before amyloidosis. In this research, we consider the K3 segment(residue 20-41) whose pdb id is 2E8D, whose cross-section exhibits U-shape. Especially, the hydropathic peptide (²¹NFLNCYVSGFH³¹) is believed to play an important role in the amyloidosis of the β₂m. Therefore, in this research, the amyloid fibril of β₂m whose sequence is NFLNCYVSGFH is investigated. We construct the amyloid fibril of β₂m varying thickness with various number of filaments, and obtain the helical pitch of the fibrils using Molecular Dynamic Simulation technique. Moreover, the mechanical properties such as elastic modulus are calculated by using Elastic Network Model with normal mode analysis. We anticipate that this research sheds light on the understanding the structure-property-function relationship of the amyloid fibrils.
#β2-microglobulin(베타 2 미세글로불린) #Amyloid fibril(아밀로이드 섬유) #Dialysis-related amyloidosis(투석 관련 아밀로이드증) #Molecular Dynamic Simulation technique(분자동역학 기법) #Elastic Network Model(탄성 네트워크 모델) #Normal Mode Analysis(정규모드 해석)

목차

Abstract
1. 서론
2. 이론과 모델링
3. 결과
4. 결론
참고문헌

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