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본 연구는 소 유전자 database들에 대한 사전 비교연구에서 발견된 삽입/결실(indel) marker들의 다형성과 각각의 유전자형의 분포를 확인하고자 수행하였다. 먼저, 소의 유전체 서열과 발현서열표식(EST) database 간의 생물정보학적 비교를 통해 전체 51 종의 indel marker들을 검출하였다. 이 중에서 42 종을 평가하여 최종적으로 9 종의 정보력이 있는 marker들을 집단분석을 위해 선발하였다. 각각의 marker들에 대한 염기서열을 재분석하였으며, marker의 다형성을 한국 재래소 품종인 한우와 제주흑우(JBC), Holstein, Angus, Charolais, Hereford 등 6 품종에서 조사하였다. 본 연구에서 이용한 소 6 품종은 8 종의 marker들에 대해 다형성을 나타내었으나, Indel_15의 경우 Holstein과 Charolais에서 다형성이 발견되지 않았다. JBC 집단에 대한 분석에서는 관찰된 이형 접합자 빈도는 HW_G1 (0.600)에서 가장 높고, Indel_29 (0.274)에서 가장 낮았다. Marker에 대한 다형정보량의 수준은 HW_G4 (0.373)에서 가장 높고, Indel_6 (0.305)에서 가장 낮은 수준을 보였다. 본 연구에서 조사한 새로운 indel marker들은 특히 제주흑우 집단의 생산성 향상을 위한 분자육종 체계의 개발뿐만 아니라 친자확인이나 생산이력추적을 위한 유전정보를 제공하는데 유용할 것으로 기대된다.
목차
서 론
재료 및 방법
결과 및 고찰
감사의 글
References
초록
참고문헌 (35)
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1. [학술지(정기간행물)] - Arranz, J. J. / 1996 / Comparison of protein markers and microsatellites in differentiation of cattle populations / Anim. Genet 27 : 415 ~ 419
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3. [학술지(정기간행물)] - Brinkmann, B. / 1998 / Mutation rate in human microsatellites: influence of the structure and length og the tandem repeat / Am. J. Hum. Genet 62 : 1408 ~ 1415
4. [학술지(정기간행물)] - Chen, C. / 2012 / Presenilin-2 polymorphisms and risk of sporadic AD: Evidence from a meta-analysis / Gene 503 : 194 ~ 199
5. [학술지(정기간행물)] - Chen, Z. / 2012 / Spinocerebellar ataxia type 27 (SCA27) is an uncommon cause of dominant ataxia among Chinese Han population / Neurosci. Lett 520 : 16 ~ 19
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