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학술저널
저자정보
Ki-Wook Chung (성균관대학교) Seok Won Kim (성균관대학교) Sun Wook Kim (성균관대학교)
저널정보
대한외과학회 Annals of Surgical Treatment and Research 대한외과학회지 Vol.82 No.5
발행연도
2012.5
수록면
271 - 280 (10page)

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Purpose: The incidence of papillary thyroid carcinomas (PTCs) is rapidly increasing in Korea. Analyzing the gene expression profiling (GEP) of PTCs will facilitate the advent of new methods in diagnosis, prognostication, and treatment. We performed this study to find the GEP of Korean PTCs. Methods: We performed oligonucleotide microarray analysis with 19 PTCs and 7 normal thyroid glands. Differentially expressed genes were selected using a t-test (|fold| ＞3) and adjusted Benjamini-Hochberg false discovery rate P-value ＜ 0.01. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (QRT-PCR) was used to validate microarray data. A classification model was developed by support vector machine (SVM) algorithm to diagnose PTCs based on molecular signatures. Results: We identified 79 differentially expressed genes (70 up-regulated and 9 down-regulated) according to the criteria. QRT-PCR for five genes (CDH3, NGEF, PROS1, TGFA, MET) was confirmatory of the microarray data. Hierarchical cluster analysis and a classification model by the SVM algorithm accurately differentiated PTCs from normal thyroid gland based on GEP. Conclusion: A disease classification model showed excellent accuracy in diagnosing PTCs, thus showing the possibility of molecular diagnosis in the future. This GEP could serve as baseline data for further investigation in the management of PTCs based on molecular signatures.
#Thyroid neoplasms #Papillary #Microarray #Gene expression profiling

목차

INTRODUCTION
METHODS
RESULTS
DISCUSSION
CONFLICTS OF INTEREST
ACKNOWLEDGEMENTS
REFERENCES

참고문헌 (30)

참고문헌 신청
1. [보고서] - Ministry of Health & Welfare / 2011 / Cancer facts and figures 2011 in the Republic Korea google schola 2. [학술지(정기간행물)] - Yu GP / 2010 / Thyroid cancer incidence and survival in the national cancer institute surveillance, epidemiology, and end results race/ethnicity groups / Thyroid 20 : 465 ~ 473 google schola 3. [학술지(정기간행물)] - Davies L / 2002 / Increasing incidence of thyroid cancer in the United States, 1973-2002 / JAMA 295 : 2164 ~ 2167 google schola 4. [단행본] - Nishiyama RH / 2005 / Pathology of tumors of the thyroid gland, In Textbook of endocrine surgery. 2nd ed / Elsevire Saunders : 223 ~ 247 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - 김정렬 / 2004 / A multigene assay to predict recurrence of tamoxifen-treated, node-negative breast cancer / NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE 351 (27) : 2817 ~ 2826 google schola

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