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본 연구는 한우 유전체 전장에 존재하는 고밀도 단일염기다형을 DNA chip을 이용하여 각각의 유전자형을 구명하고, 동일염색체 내에 존재하는 각 표지인자쌍의 연관불평형을 성 염색체를 제외한 모든 상염색체에서 추정하여 물리적 거리별 연관불평형의 정도를 확인하고 이러한 결과를 이용하여 한우 집단의 유효집단 크기를 추정하기 위하여 실시하였다. 한우개량사업소에서 2005년부터 2008년까지 후대검정에 공시된 후보종모우 및 후대 검정우 288두에 대해 혈액을 채취하고 Bovine SNP 50 DNA Chip을 이용하여 유전자형을 분석하였으며, 총 51,582 표지인자 중 결측률이 10% 이상인 표지인자 1개 및 다형성이 없는 표지인자 10,730개에 대해 사전제거를 실시하고 남은 40,851개의 SNP표지인자를 본 분석에 활용하였다. 연구 결과, 성 염색체를 제외한 상 염색체의 총 SNP표지인자의 길이는 2,541.6 Mb였으며, 염색체별 평균 SNP표지인자간 거리는 0.55에서 0.74로 분포하였으며, EM알고리즘을 이용하여 염색체별 연관불평형을 추정해 보았을 때, 기존의 보고된 연구와 유사하게 표지인자간 거리가 짧을수록 높게 나타나는 지수형태의 그래프를 나타냈으며, SNP표지인자간 거리에 따른 r2를 보면, 0 Mb에서 0.1 Mb일 때 0.136, 0.1-0.2 Mb에서 0.06로 나타났다. Luo (1998)의 연구결과를 한우에 적용시켰을 때, 전체분산의 5%이상 설명하는 양적형질좌위 발굴을 위해서 약 2,000두의 표현형 자료가 필요할 것으로 사료되었다. 또한 한우의 세대별 유효집단 크기에 대해 추정해 본 결과, 현재 한우의 유효집단크기는 84두로 추정되었고, 지금으로부터 약 50세대 이전의 유효집단 크기는 1,150두로 추정되었다. 가축에서 인공수정이 도입(1960년대)된 이 후 개량의 가속화로 인해 한우의 유효집단 크기가 급격히 감소한 것으로 사료되었다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
감사의 글
References
초록
참고문헌 (24)
참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - Hailu Dadi Melka / 2012 / Evaluation of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Genotyped by the Illumina Bovine SNP50K in Cattle Focusing on Hanwoo Breed / ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES 25 (1) : 28 ~ 32
2. [학술지(정기간행물)] - Du, F. X. / 2007 / Charaterizing Linkage Disequilibrium in Pig Populations / Int. J. Biol. Sci 3 : 166 ~ 178
3. [학술지(정기간행물)] - Excoffier, L. / 1995 / Maximum-likelihood-estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population / Mol. Biol. Evol 12 : 921 ~ 927
4. [기타자료] - Hayes, B. J. / 2008 / Course Notes 'QTL Mapping, Mas, and Genomic Selection'
5. [학술지(정기간행물)] - Hayes, B. J. / 2008 / Accuracy of genomic breeding values in multi-breed dairy cattle populations / Genetic Selection Evolution : 41 ~ 51
2. [학술지(정기간행물)] - Du, F. X. / 2007 / Charaterizing Linkage Disequilibrium in Pig Populations / Int. J. Biol. Sci 3 : 166 ~ 178
3. [학술지(정기간행물)] - Excoffier, L. / 1995 / Maximum-likelihood-estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population / Mol. Biol. Evol 12 : 921 ~ 927
4. [기타자료] - Hayes, B. J. / 2008 / Course Notes 'QTL Mapping, Mas, and Genomic Selection'
5. [학술지(정기간행물)] - Hayes, B. J. / 2008 / Accuracy of genomic breeding values in multi-breed dairy cattle populations / Genetic Selection Evolution : 41 ~ 51
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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2013-470-001699257