Deinococcus radiodurans RecA 단백질의 외가닥 DNA-의존성 ATPase 활성 분석

김종일

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자료유형: 학술저널

저자정보: 김종일 (서울여자대학교)

저널정보: 한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 43권 4호

발행연도: 2007.12

수록면: 250 - 255 (6page)

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Deinococcus radiodurans recA는 이 미생물의 방사선 저항성을 나타내는 표현형에 필수적이며 재조합성 DNA 수선 과정에 관여한다. 이 과정에서 RecA 단백질은 DNA와 결합하여 반응의 활성 종인 RecA nucleoprotein 필라멘트를 형성한다. DNA-의존성 ATPase 활성과 함께, RecA 단백질의 외가닥 DNA 혹은 이중가닥 DNA와의 상호작용은 RecA 단백질이 관여하는 반응의 중심과정으로 이에 관한 분석을 시도하였다. D. radiodurans RecA 단백질은 DNA에 결합한 DNA-단백질 복합체만이 ATPase 활성을 나타내므로, ATP (혹은 dATP) 가수분해를 측정함으로써 RecA와 외가닥 DNA와의 상호작용 정도를 분석하였다. D. radiodurans RecA 단백질은 외가닥 DNA의 염기구성의 이질성에 영향을 받았으며, homopolymer인 poly(dT)와의 상호작용에서 가장 높은 가수분해 활성을 보였다. Homopolymer인 합성 DNA-의존성 ATP 및 dATP의 가수분해는 pH 6.0과 9.0의 범위에서 다소 일정한 속도로 일어났으며 최적 pH는 7.0과 7.5 사이였다. 외가닥 DNA-의존성 ATPase 활성은 염의 존재에 영향을 받아 KCl이 존재하면 다소 억제되나, K-glutamate가 존재하면 오히려 촉진되었다. RecA 단백질과 외가닥 DNA의 상호작용을 ATP 가수분해로 분석하였을 때 2 mM 이상의 magnesium 이온이 DNA 결합반응에 필요하였으며, 비교적 넓은 범위의 pH에서 외가닥 DNA와의 결합반응이 일어나며, 이러한 결합반응은 당량적인 비(1:3, RecA protein: DNA nucleotide)로 일어났다.

#ATP hydrolysis #Deinococcus radiodurans #DNA-dependent ATPase #RecA protein

참고문헌 (13)

참고문헌 신청

, , Evidence for the coupling ofATP hydrolysis to the final phase of RecA proteinmediatedDNA strand exchange 271 : 5725 ~ 5732

, 1996 , Expression ofRecA in Deinococcus radiodurans 178 : 130 ~ 135

, 1999 , Recombinational DNA repair in bacteria and theRecA protein 63 : 310 ~ 366

, , and K.W. Minton. 199 In vivodamage and RecA-dependent repair of plasmid and chromosomalDNA in the radiation-resistant bacterium Deinococcus radiodurans.J. Bacteriol. 176 : 3508 ~ 3517

, 2001 , Predicted highly expressed andputative alien genes of Deinococcus radiodurans and implicationsfor resistance to ionizing radiation damage 98 : 5240 ~ 5245

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