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EunHye Jung (충북대학교) KwiSung Park (충청남도보건환경연구원) KyoungAh Baek (충청남도보건환경연구원) DongUk Kim (충청남도보건환경연구원) Shien-Young Kang (충북대학교) ByungHak Kang (한국질병관리본부) Doo-Sung Cheon (한국질병관리본부)
저널정보
대한미생물학회 JOURNAL OF BACTERIOLOGY AND VIROLOGY JOURNAL OF BACTERIOLOGY AND VIROLOGY Vol.40 No.4
발행연도
2010.12
수록면
191 - 198 (8page)

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Echovirus 6 (ECV6) is the prevalent serotype detected in aseptic meningitis cases in Korea. To analyze the genetic variation of ECV6 isolates recently circulating in Korea, we determined the partial sequence of the VP1 capsid gene from 22 Korean ECV6 isolates and performed pairwise analysis against 42 reference strains from the GenBank database using MegAlign. The 22 Korean ECV6 isolates formed 3 distinct genetic clusters: Kor-lineage Ⅰ, Ⅱ, and Ⅲ. The Korean ECV6 strains showed significant genetic diversity with 14.8~22.8% nucleotide divergence among the 3 different lineages. These ECV6 Kor-lineages were demonstrated to belong to different genetic clusters using VP1 sequence-based phylogenetic analysis, implying that the recently circulating Korean ECV6 strains have potential antigenic variation.
#Echovirus 6 #VP1 capsid gene #Phylogenetic analysis

목차

INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
RESULTS
DISCUSSION
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