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학술대회자료
저자정보
오민아 (고등과학원) 주기형 (고등과학원) 이주영 (고등과학원)
저널정보
한국산업응용수학회 한국산업응용수학회 학술대회 논문집 한국산업응용수학회 학술대회 논문집 Vol.4 No.2
발행연도
2009.11
수록면
91 - 94 (4page)

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단백질 구조 및 리간드 (ligand) 결합부위에 대한 정보는 단백질 기능을 이해하는데 중요한 가이드 역할을 한다. 본 연구에서는 리간드 결합부위 예측을 위해 크게 두 단계의 계산이 수행되었다. (1) 아미노산 서열로부터 템플릿 기반 모델링 방법을 사용, 단백질의 3차 구조가 예측되었다. (2) 단백질 구조 예측에 사용된 단백질-리간드 복합체 구조를 이용, 예측된 단백질 모델로부터 단백질-리간드 결합부위를 예측하였다. 이 방법은 27개 CASP8 기능 예측 단백질에 대해서 적용 되었고, Accuracy=70, Coverage=80의 우수한 결과를 냈다. 특히, 단백질-리간드 결합부위의 예측에 사용된 단백질 모델 대신에 실험에 의해 결정된 native 구조를 사용했을 경우 그 결과에서 큰 차이를 보이지 않았다. 단백질-리간드 결합부위 예측은 리간드에 대한 정보 없이 수행되었는데, 많은 경우에 실재로 native에서 결합하는 리간드는 상이했음에도 불구하고 본 연구의 접근방법은 성공적이었다.

목차

요약
서론
방법
결과
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