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한국원예학회 HORTICULTURE ENVIRONMENT and BIOTECHNOLOGY HORTICULTURE ENVIRONMENT and BIOTECHNOLOGY Vol.50 No.6
발행연도
2009.12
수록면
519 - 524 (6page)

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Genetic diversity of plant species can be evaluated by various methods. The DNA markers are one of the most powerful techniques, because they are not affected by environmental factors as well as plant developmental stages. Markers such as RAPD, AFLP, RFLP and SSR are used for studying genetic diversity of plants. In order to corroborate our results and to minimize the experimental errors, in the present study, AFLP and RAPD markers were used. Genetic similarities (GS) were calculated for both markers using the Jaccard and Dice algorithms. Six AFLP primer combinations used in this study generated 475 scorable bands, of which 336 bands were polymorphic, while the 12 RAPD primers produced 130 bands, of which 118 showed polymorphism. Using Jaccard and Dice algorithms, correlation between the genetic similarity and cophenetic coefficient (CCC) for RAPD marker were 0.82 and 0.77, respectively. In the case of AFLP, CCC was 0.91 and 0.89, respectively. The highest CCCs were calculated with the Jaccard method.
#dice #genetic similarity #Jaccard #polymorphism #SSR

목차

Abstract
Introduction
Material and methods
Results
Discussion
Literature Cited

참고문헌 (17)

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1. [학술지(정기간행물)] - Behboodi,B / 2003 / Ecological distribution study of wild pistachios for selection of rootstock / Options Mediterranean’s, Series A, Numero 63 : 61 ~ 67 google schola 2. [학술지(정기간행물)] - Doyle, J.J / 1987 / A rapid isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue / Phytochemical Bulletin 19 : 11 ~ 15 google schola 3. [단행본] - Engler,A / 1881 / Burseraceae et Anacardiaceae / Monographie Phanerogamarum : 284 ~ 293 google schola 4. [학술지(정기간행물)] - Kafkas,S / 2006 / Phylogenetic analysis of the genus Pistacia by AFLP markers / Plant. Syst. Evol. 262 : 113 ~ 124 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - Kafkas, S / 2002 / Interspecific relationship in the genus Pistacia L. (Anacardiaceae) based on RAPD fingerprinting / J. Hort. Sci 37 : 168 ~ 171 google schola

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