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한국지능시스템학회 한국지능시스템학회 학술발표 논문집 한국퍼지 및 지능시스템학회 2004년도 춘계학술대회 학술발표논문집 제14권 제1호
발행연도
2004.4
수록면
93 - 96 (4page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2004

미생물 다양성 분석을 위한 웹기반의 생물정보도구 개발
강병철 ,  김현진 ,  박준형 외 2명 한국지능시스템학회 논문지 2004.08 학술저널
미생물 다양성 분석을 위한 웹 기반의 생물정보도구 개발
강병철 ,  김현진 ,  박희경 외 1명 한국지능시스템학회 학술발표 논문집 2004.04 학술대회자료

초록· 키워드

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생태학, 환경공학, 임상진단 등 여러 생물학 분야에서 미생물의 다양성 연구의 중요성이 대두되고 그 연구가 점증하고 있다. 특히 16S rRNA를 분자지표로한 DNA 염기서열 분석방법이 널리 사용되고 있다. 본 논문에서는 16S rRNA의 염기서열 분석과정을 각 단계별로 자동화하고, 생물학자들의 결과 판단이나 사용상의 연의를 도모하기 위하여 웹기반의 미생물 다양성 분석 어플리케이션을 개발하였다. 개발을 위하여 단계별 자동화 및 인터페이스 개발에 적합한 폴더-프로세스-필터 모델을 고안하고 적용하였다. 제공되는 생물정보분석도구는 서열입력, 서열방향교정, 다중서열정렬 및 가시화, 서열동정 등의 분석등이 있으며, 각 결과는 계통분류도구와 호환가능하도록 하였다. 또한 신생아의 장내 세균총에 대한 분석을 수행하여 개발된 도구의 유용성을 확인하였다.
개발된 웹 에플리케이션은 리눅스 시스템 상에서 Perl 과 CGI를 이용하였으며, http://home.pusan.ac.kr/~genome/tools/fat.htm 으로 접속하여 사용할 수 있다.

목차

요약
1. 서론
2. 시스템 구성 및 개발방법
3. 결과 및 고찰
4. 결론 및 향후 연구
5. 참고문헌

참고문헌 (0)

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