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대한기계학회 대한기계학회 논문집 A권 대한기계학회논문집 A권 제31권 제8호
발행연도
2007.8
수록면
826 - 832 (7page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2007

분할 적분 기법을 적용한 N-sigma-T 분자동역학 전산모사
박시동 ,  조맹효 대한기계학회 논문집 A권 2007.08 학술저널

2005

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Fully flexible cell preserves Hamiltonian in structure so that the symplectic time integrator is applicable to the equations of motion. In the direct formulation of fully flexible cell N-Sigma-T ensemble, a generalized leapfrog time integration (GLF) is applicable for fully flexible cell simulation, but the equations of motion by GLF has structure of implicit algorithm. In this paper, the time integration formula is derived for the fully flexible cell molecular dynamics simulation by using the splitting time integration. It separates flexible cell Hamiltonian into terms corresponding to each of Hamiltonian term. Thus the simple and completely explicit recursion formula was obtained. We compare the performance and the result of present splitting time integration with those of the implicit generalized leapfrog time integration.
#explicit Integration(외연적분) #Splitting Time Integrator(분할적분기법) #Symplectic Integration(심플렉틱 적분) #Molecular Dynamics(분자동역학) #Flexible Cell(변형가능 셀)

목차

Abstract
1. 서론
2. 방법론
3. 전산모사 결과
4. 결론
후기
참고문헌

참고문헌 (15)

참고문헌 신청
Hernández, E., 2001, “Metric-Tensor Flexible-Cell Algorithm for Isothernal-Isobaric Molecular Dynamics Simulation,” J. Chem. phys., Vol. 115, No. 22, pp. 10282~10290. google schola Souza, I. and Martins, J. L., 1997, “Metric Tensor as the Dynamical Variable for Variable-Cell-Shape Molecular Dynamics,” Phys. Rev. B, Vol. 55, pp. 8733~8742. google schola Bond, S. D., Leimkuhler, B. J. and Laird, B. B., 1999, “The Nosé-Poincaré Method for Constant Temperature Molecular Dynamics,” J. Comput. Phys., Vol. 151, pp. 114~134. google schola Choi, K. and Cho, M., 2006, “Fully Flexible Unit Cell Simulation with Recursive Thermostat Chains,” J. Chem. Phys., Vol. 125, pp. 184105 google schola Nosé, S., 2000, “An Improved Symplectic Integrator for Nose-Poincare Thermostat,” Journal of the Physical Society of Japan., Vol. 70, No. 1, pp. 75~77. google schola

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