한국산 벼 흰잎마름병균, Xanthomonas campestris pv. oryzae, 122 균주 중 5 균주에서 알칼리추출 방법으로 내생 플라스미드를 분리할 수 있었다. 위의 방법으로 여러개의 플라스미드 밴드가 일반적으로 분리되었으나, 추출한 플라스미드를 열처리 하거나 제한효소로 절단한 후 또는 플라스미드 DNA 추출과정에서 alkaline-SDS와 sodium acetate의 양과 비율을 달리한 후에 전기영동상에 나타나는 플라스미드 밴드의 이동속도에 근거하여 상기의 여러 밴드는 동일한 플라스미드의 구조적으로 다른 형태임이 밝혀졌다. 공시한 3개 균주 8604005, 8604136, 8604143은 각각 크기가 8.2-, 7.5-, 7.0-kbp인 한 종류의 플라스미드를 갖고 있었으며, 3개의 플라스미드는 모두 제한효소 Eco RI에 한개의 절단부위를 갖고 있었다. 제한효소 Sau 3A로 절단하였을 경우에는, 8604005 균주에서 분리한 플라스미드는 8604136 균주와 8604143 균주에서 분리한 플라스미드와 제한효소단편크기형태 (RFLP)에서 뚜렷한 차이를 보였다. 기주에 접종한 후 재 분리한 8604136 균주에서도 모균주와 동일한 크기의 플라스미드가 분리되었으며, 그 플라스미드는 Bam HI, Sal Ⅰ, Pst Ⅰ, Kpn Ⅰ, Sst Ⅰ과 Hind Ⅲ과 같은 제한효소 모두에 각각 한개의 절단부위를 갖고 있었으나, Xba Ⅰ, Xbo Ⅰ과 Bgl Ⅱ로는 전달되지 않았다. 내생 플라스미드의 존재 유무는 병원력, 항생물질 저항성, 영양요구성, 균총색, 점성과 같은 표현형질과는 상관이 없었다.
Isolation of indigenous plasmid DNA was reproducible in five of 122 Korean strains of Xanthomonas campestris pv. oryzae, the causal organism of rice bacterial blight, by the alkaline extraction method. Several plasmid bands were generally produced by the method, but the multiple bands were identified as structurally different forms of a unique plasmid based on electrophoretic mobility of the bands after digestion with restriction endonucleases or heat treatment of the extracted plasmid, or by changing the amount and ratio of alkaline-SDS and sodium acetate during plasmid DNA extraction procedure. The three candidate strains, 8604005, 8604136 and 8604143 had a single plasmid with molecular size of 8.2-kbp, 7.5-kbp and 7.0-kbp, respectively, and all the plasmids had a unique restriction site for endonuclease Eco RI. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the plasmid from strain 8604005 was distinctly different from that of the plasmids from strains, 8604136 and 8604143, when digested with Sau 3A. The reisolated strain 8604136 after host passage showed the maintenance of the plasmid with the same molecular size as that of the parental strain. The plasmid DNA from strain 8604136 also had a unique restriction site for several restriction endonucleases, Bam HI, Sal Ⅰ, Pst Ⅰ, Kpn Ⅰ, Sst Ⅰ or Hind Ⅲ, but was not digested with Xba Ⅰ, Who Ⅰ, Bgl Ⅱ. No correlationship was found between the presence of indigenous plasmid and phenotypic characters such as virulence, antibiotic resistance, nutritional requirement, colony color and mucosity.